53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2482 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  100 
 
 		 334 aa  679    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2192  spore coat protein CotS  99.1 
 
 		 333 aa  672    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00336173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0543  spore coat protein, CotS family  43.65 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2398  putative spore coat protein  39.88 
 
 		 329 aa  272  6e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0017  spore coat protein, CotS family  31.91 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2196  spore coat protein, putative  30.06 
 
 		 335 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0443073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2486  putative spore coat protein  28.93 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000540962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1978  hypothetical protein  28.75 
 
 		 359 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2267  putative spore coat protein  28.1 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2484  putative spore coat protein  30.94 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2194  spore coat protein, putative  30.79 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00168617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3824  CotS family spore coat protein  24.85 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1084  spore coat protein  30 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2083  spore coat protein CotS  28.35 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.694942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1083  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  25.45 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5431  spore coat protein CotS  27.97 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.472752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1090  spore coat protein, CotS family  26.8 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.26177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5429  spore coat protein CotS  25.45 
 
 		 352 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.917959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2081  spore coat protein CotS  24.24 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1130  spore coat protein, CotS family  25.17 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1639  spore coat protein, CotS family  23.19 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0449  aminoglycoside phosphotransferase  21.34 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0541  spore coat protein, CotS family  24.53 
 
 		 337 aa  90.1  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1091  spore coat protein, CotS family  22.48 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0542  hypothetical protein  24.46 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2898  spore coat protein YutH  23.79 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0693926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5094  spore coat protein cotS  24.02 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  21.4 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4823  spore coat protein cotS  23.39 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5088  spore coat protein cotS  24.02 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4680  spore coat protein  24.02 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5188  spore coat protein cotS  23.39 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5096  spore coat protein cotS  23.53 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0146  spore coat protein cotS  23.53 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3555  spore coat protein YutH  23.69 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4661  spore coat protein  23.39 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  35.85 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3823  aminoglycoside phosphotransferase  21.67 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5058  spore coat protein cotS  22.94 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0151  aminoglycoside phosphotransferase  24.54 
 
 		 374 aa  46.2  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4773  spore coat protein YutH  22.36 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3578  aminoglycoside phosphotransferase  22.84 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119492  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1409  aminoglycoside phosphotransferase  30.61 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2434  aminoglycoside phosphotransferase  21.76 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5422  aminoglycoside phosphotransferase  21.76 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0508095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0682  aminoglycoside phosphotransferase  23.12 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0661  aminoglycoside phosphotransferase  20.66 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  24.46 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3043  spore coat protein YutH  19.47 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  33.96 
 
 		 247 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2120  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  35.48 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1644  aminoglycoside phosphotransferase  25.71 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>