23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5422 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2434  aminoglycoside phosphotransferase  92.41 
 
 		 396 aa  707    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3578  aminoglycoside phosphotransferase  97.22 
 
 		 396 aa  746    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119492  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4687  aminoglycoside phosphotransferase  91.86 
 
 		 396 aa  724    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3846  aminoglycoside phosphotransferase  92.11 
 
 		 396 aa  726    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.646827 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5422  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 396 aa  787    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0508095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3676  aminoglycoside phosphotransferase  91.86 
 
 		 396 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5034  aminoglycoside phosphotransferase  85.53 
 
 		 396 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.956259 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02691  aminoglycoside phosphotransferase  46.93 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7830  aminoglycoside phosphotransferase  41.34 
 
 		 380 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0151  aminoglycoside phosphotransferase  42.66 
 
 		 374 aa  252  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0714  aminoglycoside phosphotransferase  27.3 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2288  homoserine kinase  26.8 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  25.45 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0483  serine/threonine protein kinase  27.87 
 
 		 354 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3823  aminoglycoside phosphotransferase  24.36 
 
 		 344 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  23.08 
 
 		 334 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0059  serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.39318  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3817  homoserine kinase  32.73 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2520  serine/threonine protein kinase  24.71 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.549925  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1892  aminoglycoside phosphotransferase  21.94 
 
 		 344 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  34.57 
 
 		 355 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2605  serine/threonine protein kinase  23.71 
 
 		 327 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00251914  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0576  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 		 351 aa  42.7  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>