25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3578 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2434  aminoglycoside phosphotransferase  92.64 
 
 
396 aa  710    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724422  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4687  aminoglycoside phosphotransferase  91.86 
 
 
396 aa  728    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3578  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
396 aa  790    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119492  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5422  aminoglycoside phosphotransferase  97.22 
 
 
396 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0508095  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3676  aminoglycoside phosphotransferase  91.86 
 
 
396 aa  728    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3846  aminoglycoside phosphotransferase  92.11 
 
 
396 aa  730    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.646827 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5034  aminoglycoside phosphotransferase  85.57 
 
 
396 aa  677    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.956259 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02691  aminoglycoside phosphotransferase  47.2 
 
 
385 aa  292  8e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0151  aminoglycoside phosphotransferase  42.38 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7830  aminoglycoside phosphotransferase  40.22 
 
 
380 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0714  aminoglycoside phosphotransferase  27.86 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3823  aminoglycoside phosphotransferase  24.05 
 
 
344 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2288  homoserine kinase  26.8 
 
 
413 aa  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  25.89 
 
 
319 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0483  serine/threonine protein kinase  27.87 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  22.22 
 
 
334 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  28.7 
 
 
328 aa  47  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3817  homoserine kinase  33.33 
 
 
318 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1892  aminoglycoside phosphotransferase  22.26 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2520  serine/threonine protein kinase  26.05 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.549925  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2605  serine/threonine protein kinase  23.71 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00251914  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  32.26 
 
 
355 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0059  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
327 aa  43.5  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.39318  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0576  serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 
351 aa  43.5  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0246  serine/threonine protein kinase  26.11 
 
 
328 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000015453  hitchhiker  0.000046436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>