29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1978 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2267  putative spore coat protein  97.75 
 
 		 359 aa  709    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1978  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  729    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  28.75 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2192  spore coat protein CotS  28.44 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00336173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0543  spore coat protein, CotS family  30.36 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2486  putative spore coat protein  27.79 
 
 		 335 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000540962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2196  spore coat protein, putative  27.19 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0443073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2398  putative spore coat protein  24.75 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5431  spore coat protein CotS  25.24 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.472752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0017  spore coat protein, CotS family  27.05 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2083  spore coat protein CotS  26.37 
 
 		 350 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.694942  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1090  spore coat protein, CotS family  24.83 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.26177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1130  spore coat protein, CotS family  24.56 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1084  spore coat protein  25 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1083  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  21.81 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0449  aminoglycoside phosphotransferase  21.4 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3824  CotS family spore coat protein  22.9 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2484  putative spore coat protein  24.31 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2194  spore coat protein, putative  25.61 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00168617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0541  spore coat protein, CotS family  23.95 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1639  spore coat protein, CotS family  21.75 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1091  spore coat protein, CotS family  21.56 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5429  spore coat protein CotS  19.05 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.917959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2081  spore coat protein CotS  21.45 
 
 		 355 aa  52.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  20.68 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  22.16 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  23.15 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  20.87 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  21.5 
 
 		 589 aa  42.7  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>