28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2267 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2267  putative spore coat protein  100 
 
 
359 aa  731    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1978  hypothetical protein  97.75 
 
 
359 aa  709    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  30.51 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2192  spore coat protein CotS  30.17 
 
 
333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00336173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0543  spore coat protein, CotS family  30 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2486  putative spore coat protein  27.79 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000540962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2196  spore coat protein, putative  27.19 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0443073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2398  putative spore coat protein  25.51 
 
 
329 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5431  spore coat protein CotS  25.24 
 
 
372 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.472752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0017  spore coat protein, CotS family  27.65 
 
 
327 aa  99.4  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2083  spore coat protein CotS  26.37 
 
 
350 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.694942  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1090  spore coat protein, CotS family  24.83 
 
 
331 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.26177  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1130  spore coat protein, CotS family  24.56 
 
 
333 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1084  spore coat protein  24.26 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1083  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  23.05 
 
 
349 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0449  aminoglycoside phosphotransferase  21.35 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3824  CotS family spore coat protein  22.9 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2484  putative spore coat protein  24.31 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0028881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0541  spore coat protein, CotS family  23.95 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2194  spore coat protein, putative  24.91 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00168617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1639  spore coat protein, CotS family  21.75 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1091  spore coat protein, CotS family  22.26 
 
 
331 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5429  spore coat protein CotS  19.37 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.917959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2081  spore coat protein CotS  21.52 
 
 
355 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  19.8 
 
 
339 aa  47  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  21.3 
 
 
327 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  22.16 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  23.15 
 
 
319 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0952897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>