24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1644 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1644  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
331 aa  691    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1130  spore coat protein, CotS family  27.68 
 
 
333 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2083  spore coat protein CotS  25 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.694942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1083  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  25.5 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5431  spore coat protein CotS  25 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.472752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1084  spore coat protein  23.21 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1090  spore coat protein, CotS family  22.69 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.26177  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
352 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2484  putative spore coat protein  22.97 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0028881  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  34.38 
 
 
334 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  24.87 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2194  spore coat protein, putative  22.97 
 
 
342 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00168617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  26.94 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  27.46 
 
 
352 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0543  spore coat protein, CotS family  25.17 
 
 
330 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3956  aminoglycoside phosphotransferase  40.43 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1091  spore coat protein, CotS family  19.93 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0433  aminoglycoside phosphotransferase  27.11 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  23.11 
 
 
388 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  22.51 
 
 
352 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0017  spore coat protein, CotS family  22.33 
 
 
327 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  25.71 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  25.26 
 
 
359 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2486  putative spore coat protein  29.07 
 
 
335 aa  42.7  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000540962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>