94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0693 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0693  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0960  hypothetical protein  51.15 
 
 
316 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2783  hypothetical protein  53.04 
 
 
307 aa  288  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04844  hypothetical protein  48.66 
 
 
305 aa  285  8e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3082  hypothetical protein  50.16 
 
 
304 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3073  hypothetical protein  50.16 
 
 
304 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1206  hypothetical protein  49.84 
 
 
304 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3225  hypothetical protein  50.16 
 
 
304 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2796  hypothetical protein  48.85 
 
 
304 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3862  hypothetical protein  50 
 
 
294 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0036  membrane protein  51.26 
 
 
306 aa  280  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2975  hypothetical protein  48.85 
 
 
304 aa  279  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001101  membrane protein  48.29 
 
 
293 aa  278  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1294  protein of unknown function DUF368  49.84 
 
 
304 aa  278  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2879  hypothetical protein  48.52 
 
 
304 aa  278  7e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3040  hypothetical protein  49.83 
 
 
309 aa  276  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1038  hypothetical protein  46.89 
 
 
310 aa  276  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.246357  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1107  hypothetical protein  48.66 
 
 
315 aa  275  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1400  hypothetical protein  50 
 
 
292 aa  275  9e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3022  hypothetical protein  49.68 
 
 
312 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0930  hypothetical protein  47.19 
 
 
305 aa  272  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0094  hypothetical protein  48.34 
 
 
308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000305828  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2840  hypothetical protein  49.33 
 
 
311 aa  266  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0149  protein of unknown function DUF368  46.6 
 
 
332 aa  264  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1251  membrane protein  45.87 
 
 
314 aa  259  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06740  integral membrane protein  46.41 
 
 
307 aa  258  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0928  hypothetical protein  47.99 
 
 
329 aa  254  9e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0703  protein of unknown function DUF368  48.97 
 
 
316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.339954  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2633  hypothetical protein  46.23 
 
 
313 aa  247  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1858  hypothetical protein  45.45 
 
 
341 aa  241  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.685833 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1811  protein of unknown function DUF368  47.39 
 
 
317 aa  240  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2147  hypothetical protein  45.51 
 
 
294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2001  hypothetical protein  45.13 
 
 
324 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3873  hypothetical protein  47.55 
 
 
330 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1306  hypothetical protein  42.68 
 
 
309 aa  223  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1640  hypothetical protein  45.24 
 
 
291 aa  218  1e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0943  hypothetical protein  47.33 
 
 
330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0196129  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2007  hypothetical protein  41.88 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00601803  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0809  hypothetical protein  36.65 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0473658  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1921  protein of unknown function DUF368  39.36 
 
 
301 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0446  hypothetical protein  39.17 
 
 
292 aa  162  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06735  Predicted membrane protein  34.73 
 
 
342 aa  159  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260385  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  39.33 
 
 
565 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0156  protein of unknown function DUF368  41.32 
 
 
297 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0704  hypothetical protein  38.55 
 
 
290 aa  149  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.527193  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2809  protein of unknown function DUF368  38.01 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2958  protein of unknown function DUF368  39.59 
 
 
308 aa  136  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0387  protein of unknown function DUF368  31.88 
 
 
320 aa  125  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5386  hypothetical protein  35.63 
 
 
268 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5242  hypothetical protein  35.63 
 
 
268 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5261  hypothetical protein  35.63 
 
 
268 aa  122  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5006  hypothetical protein  35.63 
 
 
268 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5318  hypothetical protein  35.63 
 
 
268 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4835  hypothetical protein  35.63 
 
 
268 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4850  hypothetical protein  35.63 
 
 
268 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5276  hypothetical protein  35.22 
 
 
268 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.348652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5681  hypothetical protein  35.22 
 
 
268 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20100  predicted membrane protein  31.02 
 
 
337 aa  119  7.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00191645  normal  0.0169787 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24370  predicted membrane protein  34.26 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4950  hypothetical protein  34.41 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1370  hypothetical protein  34.72 
 
 
303 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1628  hypothetical protein  34.72 
 
 
301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3629  protein of unknown function DUF368  35.43 
 
 
318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0842  hypothetical protein  34.65 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0142899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0858  hypothetical protein  34.65 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0784  hypothetical protein  33.47 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2249  hypothetical protein  34.29 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1061  protein of unknown function DUF368  31.56 
 
 
314 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0495  hypothetical protein  31.43 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.322978  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0761  hypothetical protein  33.48 
 
 
253 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3700  hypothetical protein  34.15 
 
 
268 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.435623  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0644  hypothetical protein  29.96 
 
 
249 aa  103  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0540677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0607  protein of unknown function DUF368  32.26 
 
 
309 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1638  hypothetical protein  32.65 
 
 
278 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5992  protein of unknown function DUF368  34.31 
 
 
316 aa  99.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0288  protein of unknown function DUF368  29.74 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2358  protein of unknown function DUF368  32.47 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115253  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2829  protein of unknown function DUF368  36.02 
 
 
320 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3492  hypothetical protein  27.47 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0279106  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0888  protein of unknown function DUF368  29.15 
 
 
286 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1029  hypothetical protein  31.08 
 
 
279 aa  86.3  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2510  hypothetical protein  27.41 
 
 
285 aa  85.9  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000712046  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2501  protein of unknown function DUF368  33.97 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1575  protein of unknown function DUF368  27.57 
 
 
270 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0838  hypothetical protein  30.2 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1873  protein of unknown function DUF368  29.96 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000015734  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2250  hypothetical protein  30.04 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0717  hypothetical protein  29.51 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1718  hypothetical protein  30.12 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0787  hypothetical protein  27.95 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1472  hypothetical protein  26.4 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.248471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2720  membrane protein-like protein  29.73 
 
 
183 aa  52.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1510  protein of unknown function DUF368  26.39 
 
 
301 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0187  protein of unknown function DUF368  21.92 
 
 
289 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>