More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2568 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 332 aa  685    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  50.62 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  48.76 
 
 		 331 aa  348  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  49.69 
 
 		 326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  41.04 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  43.69 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  39.58 
 
 		 331 aa  275  8e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  41.37 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  39.2 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  34.27 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  33.58 
 
 		 296 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  34.04 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  34.12 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  34.47 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  33.07 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  33.79 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  33.93 
 
 		 304 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  35.5 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  32.78 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  34.55 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  35.83 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  31.65 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  32.42 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  34.49 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  32.58 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  29.61 
 
 		 330 aa  159  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  32.45 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  32.1 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  31.17 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  32.84 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  30.16 
 
 		 314 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  32.21 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  32.12 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  32.68 
 
 		 293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  32.96 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  32.04 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  34.48 
 
 		 304 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  33.11 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  33.08 
 
 		 305 aa  152  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 		 295 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 		 316 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  32.37 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  33.69 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  33.69 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  29.78 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  30.15 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 		 302 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  32.61 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  32.08 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  30.65 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  32.45 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  29.22 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  29.64 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  25.81 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  32.25 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  28.38 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 		 315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  28.35 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  26.1 
 
 		 476 aa  116  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  27.27 
 
 		 295 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  27.27 
 
 		 295 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  26.95 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  27.67 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  26.74 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  26.74 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  26.92 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  26.57 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  26.86 
 
 		 289 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  26.57 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  25.27 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  24.32 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  27.49 
 
 		 293 aa  107  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  26.24 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  26.24 
 
 		 297 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  23.31 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>