More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2536 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2536  regulatory protein MerR  100 
 
 		 111 aa  222  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1445  transcriptional regulator  49.55 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.236755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  61.96 
 
 		 109 aa  120  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1892  MerR family transcriptional regulator  56.99 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0444  transcriptional regulator, MerR family  45.19 
 
 		 208 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1008  transcriptional regulator, MerR family  41.75 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2379  transcriptional regulator, MerR family  46.94 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0580  hypothetical protein  41.35 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1052  transcriptional regulator, putative  35.19 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.019007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2382  transcriptional regulator, MerR family  35.64 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2301  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0840  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  33.73 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0058  hypothetical protein  34.31 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  37.18 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  33.65 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0291  hypothetical protein  32.38 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2056  regulatory protein MerR  35.62 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.880106  normal  0.300945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2331  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2385  transcriptional regulator, putative  33.65 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1705  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1501  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.259398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2223  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000299442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1997  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2017  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1889  MerR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  30.39 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  27.47 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  27.47 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2364  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  31.37 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1596  transcriptional regulator, MerR family  36.25 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.265626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1660  MerR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  30.68 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1288  transcriptional regulator, MerR family  34.07 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4486  transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 		 321 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892291  hitchhiker  0.0000100174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4353  transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 		 321 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  32.26 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0772  hypothetical protein  36 
 
 		 193 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1199  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 179 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1633  hypothetical protein  31 
 
 		 181 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0887  MerR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0416797  hitchhiker  0.00000266118 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0831  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 177 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.087298  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0970  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  31.58 
 
 		 125 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1328  MerR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000121427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1418  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000205103  normal  0.491097 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000181748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1148  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1772  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.318397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1366  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2516  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2749  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  34.72 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0108  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  35.21 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4387  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 757 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1752  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0206721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>