109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0898 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  577  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  43.75 
 
 
308 aa  262  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1830  hypothetical protein  42.5 
 
 
290 aa  225  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00791791  hitchhiker  0.0000000000564838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1763  hypothetical protein  41.9 
 
 
300 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0148846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  40.56 
 
 
287 aa  211  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  40.69 
 
 
318 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  38.6 
 
 
288 aa  206  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  37.88 
 
 
296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  39.58 
 
 
310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  37.04 
 
 
300 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  40.47 
 
 
322 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  36.64 
 
 
233 aa  146  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  30.87 
 
 
298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  30 
 
 
309 aa  119  6e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0894  hypothetical protein  85.19 
 
 
81 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025611 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  30.25 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0885  hypothetical protein  40.59 
 
 
183 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688729 
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  29.41 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  29.93 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  29.55 
 
 
309 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3057  hypothetical protein  27.74 
 
 
285 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3058  hypothetical protein  27.5 
 
 
289 aa  99  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  29.55 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  27.18 
 
 
293 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  27.74 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  27.45 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  28.33 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  24.66 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  28.9 
 
 
308 aa  79  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  27.45 
 
 
326 aa  79  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  28.2 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  28.2 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  26 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  25.38 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0395  hypothetical protein  29.22 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  26.67 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2413  hypothetical protein  28.04 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000810744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  28.06 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  26 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  26 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  24.57 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  26.5 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  28.25 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  25.08 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0550  hypothetical protein  35.58 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15726  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  24.84 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  27.83 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  22.07 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  25.64 
 
 
334 aa  67  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  22.19 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  25.34 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  25.53 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  24.49 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  25.09 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  23.05 
 
 
326 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3043  hypothetical protein  40.3 
 
 
187 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  24.32 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  23.21 
 
 
284 aa  62.4  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  22.93 
 
 
311 aa  62.4  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0226  hypothetical protein  36.96 
 
 
147 aa  62  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  22.44 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  23.46 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  24.92 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  22.61 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  24.19 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0691  hypothetical protein  34.78 
 
 
147 aa  59.7  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0223479  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  24.56 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2294  hypothetical protein  25.8 
 
 
276 aa  59.3  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0694  hypothetical protein  26.58 
 
 
242 aa  59.3  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  20.12 
 
 
327 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  21.51 
 
 
284 aa  59.3  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0996  hypothetical protein  25.53 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  21.9 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  22.74 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2429  hypothetical protein  25.43 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  22.89 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  23.45 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  22.33 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  20.3 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  22.14 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0398  hypothetical protein  31.52 
 
 
147 aa  53.9  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  24.21 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  20.56 
 
 
325 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0993  hypothetical protein  31.52 
 
 
147 aa  52.8  0.000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  23.02 
 
 
292 aa  52.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0539  hypothetical protein  25.91 
 
 
277 aa  52.4  0.000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  24.91 
 
 
288 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0536  hypothetical protein  31.52 
 
 
147 aa  52.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1137  hypothetical protein  26.87 
 
 
256 aa  52.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1140  hypothetical protein  31.52 
 
 
147 aa  51.6  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  24.75 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0551  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298634  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  22.9 
 
 
300 aa  49.7  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2432  hypothetical protein  23.76 
 
 
259 aa  49.3  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.870937 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  24.72 
 
 
319 aa  48.9  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  22.65 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2696  hypothetical protein  25.36 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  23.53 
 
 
330 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  22.68 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  24.34 
 
 
401 aa  46.6  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>