152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2493 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2493  cytochrome c(mono-heme type)  100 
 
 		 120 aa  248  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0117122  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  63.54 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6104  putative cytochrome c(mono-heme type)  60 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1715  hypothetical protein  43.24 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128981  normal  0.195089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0095  cytochrome c family protein  43.27 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1741  cytochrome c  51.32 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  40.82 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  45.83 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  47.14 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  43.66 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0125  cytochrome c-type protein  42.47 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  45.07 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0142  cytochrome c5-like protein  42.47 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  43.06 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0156  cytochrome c5-like protein  42.25 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5103  cytochrome c-type protein  42.47 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  45.71 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3332  cytochrome c-type protein  38.57 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0140  cytochrome c-type protein  41.1 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  44.29 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  42.25 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  44.29 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  41.77 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  41.77 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  40.74 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2981  cytochrome c-type protein  41.43 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  41.43 
 
 		 97 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6290  putative cytochrome  40.28 
 
 		 97 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  40 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  42.47 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0191  cytochrome c, class I  41.43 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000235852  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  41.43 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2849  cytochrome c family protein  36.36 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000128252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72470  putative cytochrome  40.28 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0054  cytochrome c-type protein  39.44 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  39.47 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  38.57 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  42.25 
 
 		 273 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  40 
 
 		 99 aa  67  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  40 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  40 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  40 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  40.26 
 
 		 161 aa  67  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  33.68 
 
 		 537 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  38.57 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  38.57 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  38.57 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  33.68 
 
 		 537 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  39.33 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  36.25 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  34.04 
 
 		 382 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  39.53 
 
 		 223 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2352  cytochrome c class I  37.97 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  34.44 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0941  hypothetical protein  32.46 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  37.5 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  38.16 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47940  cytochrome c5 protein  39.73 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  47.17 
 
 		 230 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  49.06 
 
 		 298 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  36.99 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0249  cytochrome c5-like protein  42.47 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0971  hypothetical protein  29.82 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0214  cytochrome c class I  35.63 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  47.17 
 
 		 297 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  38.67 
 
 		 302 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0050  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 232 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  38.67 
 
 		 302 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  49.12 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  41.94 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  49.12 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0213  hypothetical protein  38.03 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000412444  hitchhiker  0.00201322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  35.44 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0233  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0215738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5267  cytochrome c5  41.1 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  35.14 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  38.67 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  34.52 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  37.5 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5177  cytochrome c5  41.1 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129919  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  37.5 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  45.28 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2117  cytochrome c class I  30.16 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000139618  normal  0.419433 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  34.18 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  39.19 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  45.61 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  34.18 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  38.67 
 
 		 297 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  34.18 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0988  cytochrome c family protein  32.91 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5522  cytochrome c5  38.36 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0203  cytochrome c5  39.73 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768078  hitchhiker  0.00155687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 293 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  37.33 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  48.08 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  37.33 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>