44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1167 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  48.09 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  35.16 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  35.16 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  33.71 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  34.62 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  34.62 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  34.62 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  34.62 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  33.51 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  34.07 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  33.52 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  34.07 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  39.68 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  35.94 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  31.36 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  37.3 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  32.12 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  32.12 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  31.74 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  30.94 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  33.15 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  33.14 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  28.92 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  35.51 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  31.64 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  34.23 
 
 		 293 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  32.8 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  33.07 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  35.29 
 
 		 442 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  40.58 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  52 
 
 		 92 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  29.92 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  39.13 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1136  hypothetical protein  42.31 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  41.94 
 
 		 78 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  30.26 
 
 		 292 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  41.18 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  25 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  27.48 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  37.88 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0189  hypothetical protein  30.93 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  44.83 
 
 		 89 aa  41.6  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  47.06 
 
 		 88 aa  41.2  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>