More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0885 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
406 aa  829    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  74.56 
 
 
403 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  72.7 
 
 
406 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  74.13 
 
 
404 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  77.57 
 
 
396 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  76.84 
 
 
396 aa  594  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  74.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  74.2 
 
 
403 aa  570  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  73.07 
 
 
400 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  69.95 
 
 
406 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  72.75 
 
 
406 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  51.19 
 
 
432 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  50.13 
 
 
413 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  48.29 
 
 
416 aa  332  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  48.93 
 
 
403 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  48.33 
 
 
408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  47.58 
 
 
378 aa  326  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  47.68 
 
 
381 aa  325  9e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  46.88 
 
 
373 aa  319  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  44.85 
 
 
655 aa  315  9.999999999999999e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  47.73 
 
 
390 aa  311  9e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  47.73 
 
 
390 aa  311  9e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  45.89 
 
 
405 aa  311  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  47.99 
 
 
385 aa  302  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  45.14 
 
 
398 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  39.13 
 
 
441 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  45.07 
 
 
378 aa  257  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  41.89 
 
 
393 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.77 
 
 
373 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
383 aa  225  9e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
377 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 
381 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 
387 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.71 
 
 
380 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
380 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
380 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
380 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  34.95 
 
 
377 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.25 
 
 
380 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
380 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.91 
 
 
380 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  31.91 
 
 
380 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.71 
 
 
380 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
381 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  37.66 
 
 
416 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
420 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
376 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  32.1 
 
 
377 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 
333 aa  190  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  31.95 
 
 
377 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  33.51 
 
 
381 aa  189  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  30.62 
 
 
376 aa  189  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  31.04 
 
 
390 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 
387 aa  188  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
377 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  33.94 
 
 
377 aa  186  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
363 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  31.56 
 
 
377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  33.25 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  32.06 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  32.06 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  30.71 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  33.51 
 
 
381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
810 aa  182  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
377 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
377 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  31.73 
 
 
385 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  32.98 
 
 
381 aa  180  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  31.91 
 
 
382 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  34.49 
 
 
355 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
353 aa  177  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
345 aa  177  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
381 aa  177  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
355 aa  176  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 
426 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
352 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
871 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  39.38 
 
 
343 aa  176  9e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
772 aa  173  5.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 
384 aa  172  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
820 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
344 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
344 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
344 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
375 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 
816 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.68 
 
 
344 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
352 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  28.53 
 
 
372 aa  169  8e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
344 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
393 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
342 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
378 aa  168  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 
372 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
345 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>