178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2737 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2737  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
337 aa  698    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5802  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.71 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.435626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2406  twin-arginine translocation pathway signal  31.17 
 
 
337 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0420  twin-arginine translocation pathway signal  33.7 
 
 
278 aa  85.9  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  28.22 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.8 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.57 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2486  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.11 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  27.23 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  27.31 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.84 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  27.73 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  23.67 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  23.67 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  23.67 
 
 
311 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  23.67 
 
 
311 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  23.67 
 
 
311 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  23.67 
 
 
311 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  23.67 
 
 
311 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  23.67 
 
 
311 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1658  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.49 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  23.08 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.24 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  23.08 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  23.08 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  24.23 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  22.67 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2617  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.82 
 
 
322 aa  60.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.82375  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  23.27 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  24.73 
 
 
311 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  28 
 
 
311 aa  59.3  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0017  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.31 
 
 
317 aa  59.3  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3224  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.09 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00529527  normal  0.234301 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0017  Ribosylpyrimidine nucleosidase  23.4 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1442  Ribosylpyrimidine nucleosidase  24.58 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.82 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1878  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.63 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2311  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.36 
 
 
303 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.933785  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  23 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2548  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase transmembrane protein  32.11 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  22.82 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1443  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.01 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.44 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  27.78 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2157  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.06 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000654385  normal  0.648077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3408  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.48 
 
 
324 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  24.89 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  24.18 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3465  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.7 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  27.7 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0558  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  26.26 
 
 
317 aa  56.2  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000277639  hitchhiker  0.000000766068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2373  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.9 
 
 
341 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.53 
 
 
322 aa  55.8  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1461  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  26.96 
 
 
303 aa  55.8  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.19 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  25.6 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0797  ribonucleoside hydrolase RihC  25.23 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  23.83 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6548  Ribosylpyrimidine nucleosidase  29.49 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527968  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  26.53 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0759  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  27.23 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.486217  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1356  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.74 
 
 
311 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2806  protein of unknown function DUF1593  28.75 
 
 
431 aa  53.9  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.1118  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0120  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  36.96 
 
 
395 aa  53.5  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.134348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  21.99 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  24.58 
 
 
315 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1962  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.76 
 
 
335 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00495918  normal  0.0351342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  26.17 
 
 
318 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0753  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.78 
 
 
310 aa  52.8  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00064946  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.32 
 
 
311 aa  52.8  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  26.17 
 
 
318 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  26.17 
 
 
318 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  26.17 
 
 
318 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  26.53 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  26.53 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  25.45 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3230  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.08 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.618451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0651  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  22.78 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  25.85 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02729  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  27.75 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0577  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  25.24 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.113372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28400  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  24.62 
 
 
320 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3240  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.33 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206902  normal  0.22308 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0791  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.36 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  27.86 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  26.53 
 
 
318 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.59 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5263  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.86 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.03 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3658  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.37 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  0.106477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3486  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.62 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0798  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  30.05 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.190836  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  25.5 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1901  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.72 
 
 
316 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4422  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.57 
 
 
321 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4624  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.59 
 
 
350 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  24.54 
 
 
314 aa  50.4  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.51 
 
 
324 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0386  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.59 
 
 
357 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.48 
 
 
313 aa  50.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>