90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1529 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  31.53 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  31.19 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  31.19 
 
 		 290 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  31.19 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  30.72 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  30.82 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  31.06 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  31.06 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  31.06 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  31.06 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  29.11 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  29.12 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  30.38 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  28.47 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  30 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  30.77 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  27.82 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  30.31 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  28.82 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  30.14 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  29.07 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  27.6 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  32.65 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  26.94 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  28.08 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  32.48 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  28.28 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  31.83 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  28 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  32.19 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1177  galactose mutarotase-like protein  28.96 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  31.16 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  30.1 
 
 		 289 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  32.37 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  28.42 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  31.03 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  30.42 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  27.71 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1883  Aldose 1-epimerase  30.07 
 
 		 331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  29.12 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  31.09 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  30 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  29.18 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  29.93 
 
 		 291 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  27.83 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  25.08 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  26.04 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  22.64 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  26.03 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  23.11 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  26.21 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  23.08 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  23.08 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  20.78 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  23.79 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  24.07 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  25.26 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  26.98 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  26.91 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  25.36 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  21.59 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  21.59 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5126  hypothetical protein  45.61 
 
 		 122 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  21.13 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  21.13 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  26.61 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  26.29 
 
 		 312 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  24.73 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  26.09 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  26.09 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  26.09 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  23.68 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  22.6 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  21.26 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  23.56 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  27.73 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  25.66 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  27.84 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  28.96 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  22.04 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  31.58 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1587  hypothetical protein  32.47 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000393399  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  21.67 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2040  Aldose 1-epimerase  25.81 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.439926  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2838  Aldose 1-epimerase  22.95 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0834033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  22.82 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  24.03 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  27.72 
 
 		 284 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  31.71 
 
 		 302 aa  42.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>