27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0686 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  70.31 
 
 
296 aa  427  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  60.07 
 
 
299 aa  361  7.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  57.63 
 
 
295 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  58.31 
 
 
295 aa  351  7e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  46.78 
 
 
293 aa  296  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  50.17 
 
 
290 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  46.44 
 
 
293 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  48.81 
 
 
295 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  47.75 
 
 
294 aa  288  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  47.75 
 
 
294 aa  288  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  47.1 
 
 
291 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2225  putative branched chain amino acid transport protein  41.71 
 
 
232 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal  0.251816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0908  hypothetical protein  42.58 
 
 
166 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3746  hypothetical protein  29.66 
 
 
365 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864232  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  27.71 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0684  hypothetical protein  32.41 
 
 
240 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  25.79 
 
 
288 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  30 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  29.68 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0312  DNA-binding prophage protein  53.66 
 
 
89 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0632325  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  28.33 
 
 
305 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  27.5 
 
 
298 aa  49.7  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  28.12 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  24.81 
 
 
386 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.25 
 
 
399 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  25 
 
 
316 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>