45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0483 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0483  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 105 aa  213  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0293  hypothetical protein  65.56 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000404115  normal  0.251611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0276  Cro/CI family transcriptional regulator  65.56 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123998 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  32.26 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  33.73 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  33.75 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  38.46 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  38.89 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  37.14 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  31.43 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  34.29 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  26.97 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  38.6 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  34.29 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  29.73 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 106 aa  42  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  32.76 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 115 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3970  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  27.14 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  27.14 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3975  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 208 aa  40  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  34.55 
 
 		 94 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>