47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0292 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  194  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  91.67 
 
 		 98 aa  176  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  60.42 
 
 		 100 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  60.42 
 
 		 100 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  60.42 
 
 		 100 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  62.77 
 
 		 99 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  60.42 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3646  putative anti-sigma B factor antagonist  59.38 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  38.54 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  38.54 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  38.54 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  38.54 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  38.54 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  38.54 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3678  YrbB  40.62 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.002943  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0516  conserved hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000230981  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03056  hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0509  hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.784342  normal  0.1655 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3487  YrbB  40.62 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4513  YrbB  40.62 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0162677  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3385  YrbB  40.62 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000270552  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03007  hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0176989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3579  YrbB  40.62 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0908336  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  37.65 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  36.05 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  39.24 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1169  hypothetical protein  43.94 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.731709  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  37.97 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0717  SpoIIAA family protein  36.59 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3658  SpoIIAA family protein  36.59 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0726  SpoIIAA family protein  36.59 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0696  SpoIIAA family protein  36.59 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0725  SpoIIAA family protein  35.29 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  29.67 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  32.18 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  36.71 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  29.47 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  33.7 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03207  hypothetical protein  33.77 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2098  putative anti-sigma B factor antagonist  30.53 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002413  putative anti-sigma B factor antagonist  28.89 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2705  NTP binding protein  36.05 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  30.43 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  33.72 
 
 		 102 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2198  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>