More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4386 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  63.32 
 
 		 498 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  64.37 
 
 		 519 aa  657    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  63.54 
 
 		 497 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  64.75 
 
 		 500 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  74.49 
 
 		 493 aa  745    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  63.73 
 
 		 498 aa  643    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  67.14 
 
 		 489 aa  673    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  64.78 
 
 		 529 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  63.95 
 
 		 497 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  63.56 
 
 		 500 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  65.06 
 
 		 503 aa  673    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  66.19 
 
 		 494 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  67.55 
 
 		 519 aa  682    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  66.19 
 
 		 500 aa  668    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  65.78 
 
 		 500 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  98.59 
 
 		 495 aa  983    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  100 
 
 		 496 aa  998    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  64.17 
 
 		 497 aa  666    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  64.37 
 
 		 500 aa  662    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  74.29 
 
 		 493 aa  746    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  68.29 
 
 		 502 aa  663    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1320  glycerol kinase  74.49 
 
 		 493 aa  747    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  69.31 
 
 		 507 aa  678    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  64.17 
 
 		 500 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2809  glycerol kinase  66.26 
 
 		 497 aa  629  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.507542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  64.17 
 
 		 501 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  62.01 
 
 		 495 aa  621  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3316  glycerol kinase  64.29 
 
 		 497 aa  619  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307354  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  61.54 
 
 		 497 aa  619  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  61.43 
 
 		 494 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  61.43 
 
 		 494 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  61.48 
 
 		 501 aa  605  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  58.32 
 
 		 493 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  58.78 
 
 		 520 aa  581  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  57.91 
 
 		 494 aa  580  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  59.57 
 
 		 505 aa  576  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  56.12 
 
 		 497 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  57.76 
 
 		 496 aa  565  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  54.56 
 
 		 496 aa  566  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  54.16 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  56.24 
 
 		 494 aa  559  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  54.62 
 
 		 498 aa  560  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  56.85 
 
 		 502 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  53.47 
 
 		 497 aa  556  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  55.69 
 
 		 501 aa  555  1e-157  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  55.89 
 
 		 514 aa  558  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  54.71 
 
 		 513 aa  554  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  54.92 
 
 		 505 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  56.8 
 
 		 496 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2009  glycerol kinase  59.51 
 
 		 495 aa  549  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.904533  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  54.3 
 
 		 500 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  54.3 
 
 		 500 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  54.1 
 
 		 500 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  54.3 
 
 		 500 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  57.2 
 
 		 496 aa  548  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  54.1 
 
 		 503 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  54.1 
 
 		 518 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  54.1 
 
 		 503 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  54.3 
 
 		 500 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  53.56 
 
 		 501 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  55.97 
 
 		 510 aa  545  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  54.1 
 
 		 518 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  53.89 
 
 		 500 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  54.1 
 
 		 518 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  55.15 
 
 		 497 aa  547  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  54.1 
 
 		 518 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  54.1 
 
 		 518 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  55.12 
 
 		 498 aa  541  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  53.89 
 
 		 499 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  59.79 
 
 		 504 aa  542  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  53.89 
 
 		 500 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  53.69 
 
 		 499 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  57.78 
 
 		 496 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  51.02 
 
 		 498 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  53.94 
 
 		 497 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  51.02 
 
 		 498 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  50.82 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  53.48 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  53.89 
 
 		 498 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  53.16 
 
 		 496 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  52.55 
 
 		 496 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  54.07 
 
 		 497 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  52.74 
 
 		 498 aa  537  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  52.64 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  53.48 
 
 		 498 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  51.02 
 
 		 502 aa  532  1e-150  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  51.32 
 
 		 494 aa  534  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  54.97 
 
 		 501 aa  533  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1721  glycerol kinase  56.38 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  52.24 
 
 		 499 aa  530  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  57.03 
 
 		 499 aa  529  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  55.28 
 
 		 505 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  53.91 
 
 		 516 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  52.85 
 
 		 489 aa  530  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  54.99 
 
 		 499 aa  531  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  52.65 
 
 		 495 aa  531  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  54.79 
 
 		 498 aa  531  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  49.18 
 
 		 496 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  49.18 
 
 		 496 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  50.92 
 
 		 495 aa  527  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>