More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1389 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 322 aa  635    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  52.52 
 
 		 319 aa  299  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.22 
 
 		 319 aa  285  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  53.63 
 
 		 319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.67 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  53.46 
 
 		 319 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  53.14 
 
 		 319 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  47.32 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  43.31 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  44.44 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.59 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.16 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  43.13 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  44.92 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  45.36 
 
 		 326 aa  222  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  42.23 
 
 		 325 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  47.84 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  47.33 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.42 
 
 		 325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.81 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.81 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  43.81 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.67 
 
 		 326 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  43.48 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  43.33 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.67 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.3 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.51 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.67 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  44.63 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.67 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  43.62 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.95 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 326 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.96 
 
 		 324 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.9 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  44.97 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.63 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  42.95 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.95 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  40.12 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.52 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  45.63 
 
 		 340 aa  199  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  42.59 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48 
 
 		 324 aa  195  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  46.82 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  45.67 
 
 		 324 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  40.48 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  45.25 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  40.98 
 
 		 324 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.53 
 
 		 328 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  43.81 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  44.59 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  43.65 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.95 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.26 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  44.26 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.98 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.81 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.48 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  44.26 
 
 		 326 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 		 331 aa  185  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.88 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 		 326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  43.28 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.54 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.59 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  43.28 
 
 		 326 aa  182  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  41.83 
 
 		 331 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  38.63 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  42.39 
 
 		 332 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.73 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  37.58 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.02 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.62 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  41.95 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.63 
 
 		 329 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  40.8 
 
 		 329 aa  172  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.13 
 
 		 324 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4503  alcohol dehydrogenase  37.58 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  43.24 
 
 		 325 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.13 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13162  NADPH quinone oxidoreductase fadB4  35.62 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.09 
 
 		 332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.38 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  42.62 
 
 		 324 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1917  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.52 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.820902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.14 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.44 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4852  putative Zinc-dependent dehydrogenase  38.76 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249579  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1554  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1577  alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3810  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.272499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3737  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.392288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>