More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1917 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1917  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
336 aa  680    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.820902  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4852  putative Zinc-dependent dehydrogenase  47.27 
 
 
336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249579  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  43.33 
 
 
325 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.99 
 
 
328 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.35 
 
 
325 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  40.73 
 
 
325 aa  242  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0190  alcohol dehydrogenase  46.53 
 
 
339 aa  238  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  41.64 
 
 
325 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  43.64 
 
 
326 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  41.64 
 
 
325 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.82 
 
 
325 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  41.74 
 
 
324 aa  219  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 
325 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  42.9 
 
 
322 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  38.72 
 
 
325 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  44.26 
 
 
319 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  41.31 
 
 
319 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  37.31 
 
 
325 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.31 
 
 
325 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  43.61 
 
 
319 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.37 
 
 
324 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  43.28 
 
 
319 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  40.33 
 
 
324 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
324 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  39.33 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.38 
 
 
324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.86 
 
 
324 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
324 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.27 
 
 
326 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.53 
 
 
324 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.51 
 
 
319 aa  192  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.7 
 
 
324 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  37.31 
 
 
324 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.46 
 
 
327 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 
326 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.56 
 
 
326 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  36.89 
 
 
326 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.27 
 
 
326 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
324 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 
325 aa  186  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  39.68 
 
 
323 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  39.09 
 
 
323 aa  185  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
324 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37 
 
 
324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  38.82 
 
 
329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
324 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.86 
 
 
325 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  39.57 
 
 
324 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  36.81 
 
 
324 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  41.31 
 
 
331 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.81 
 
 
324 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.67 
 
 
324 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 
327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
333 aa  173  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.88 
 
 
324 aa  172  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.21 
 
 
329 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.13 
 
 
331 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.63 
 
 
361 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2364  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.51 
 
 
321 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.59 
 
 
326 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 
321 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 
321 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.35 
 
 
324 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  38.79 
 
 
325 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.35 
 
 
324 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.8 
 
 
329 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4894  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.53 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 
321 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  38.01 
 
 
331 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13162  NADPH quinone oxidoreductase fadB4  37.62 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  38.61 
 
 
340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0870  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.24 
 
 
319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  37.06 
 
 
337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.62 
 
 
324 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  35.05 
 
 
324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.15 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.7 
 
 
328 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.98 
 
 
322 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  37.11 
 
 
331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  44.17 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.38 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  32.7 
 
 
328 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  35.52 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  37.81 
 
 
324 aa  162  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  32.38 
 
 
328 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  32.7 
 
 
328 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.17 
 
 
327 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.38 
 
 
328 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 
324 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  37.73 
 
 
324 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
331 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  32.7 
 
 
328 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  40.84 
 
 
326 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.46 
 
 
326 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  32.7 
 
 
328 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.23 
 
 
324 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.84 
 
 
326 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>