84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1286 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1286  cation antiporter  100 
 
 		 162 aa  321  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.964773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  55.56 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  0.146905 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3712  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  55.56 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5265  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  47.47 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3622  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  56.17 
 
 		 165 aa  158  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.3 
 
 		 161 aa  157  8e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  49.38 
 
 		 162 aa  150  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  47.53 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3131  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.79 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4613  cation antiporter  46.63 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  hitchhiker  0.00748175 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.99 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.99 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5153  cation antiporter  46.01 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5078  cation antiporter  45.68 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2477  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.77 
 
 		 163 aa  108  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0670755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3906  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.01 
 
 		 173 aa  107  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1383  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.17 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3292  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.72 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.630258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.04 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2809  cation antiporter  41.14 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.492713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1521  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.29 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00868483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.75 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  33.95 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.57 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1602  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.41 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.04 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2227  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.65 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  34.81 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3513  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.63 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1850  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.24 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0391137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  35.8 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.13 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  33.73 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.36 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2442  multicomponent K+:H+ antiporter subunit E, pH adaptation  33.11 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.540831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.28 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955338  normal  0.798381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.12 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.25 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.41 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.62 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.25 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.25 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3474  potassium efflux system protein PhaE, putative  34.36 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.5 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.36 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.86 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  29.34 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3313  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.42 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0151  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.76 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3255  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.09 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  34.39 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.87 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  30.5 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  31.69 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.1 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.78 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  32.93 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.32 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.71 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0673  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.86 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.06 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  29.11 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30380  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  30.39 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1206  cation antiporter  30.07 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0203204 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.87 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.32 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.58 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.58 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.83 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1797  cation antiporter  32.41 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.525792  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  26.9 
 
 		 198 aa  47.4  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.66 
 
 		 167 aa  47.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  28.14 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  27.74 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  25.32 
 
 		 172 aa  44.3  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0948  membrane bound hydrogenase subunit mbhA  23.9 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0174766  normal  0.241489 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.45 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.58 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  27.47 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  29.35 
 
 		 115 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  28.7 
 
 		 115 aa  42.4  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  29.41 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  25.15 
 
 		 219 aa  40.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  27.74 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>