112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2015 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1733  inhibitor/regulator of recA, recX  86.63 
 
 		 373 aa  657    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.122628  normal  0.0971818 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2015  putative inhibitor/regulator of RecA, RecX  100 
 
 		 373 aa  772    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1982  hypothetical protein  46.93 
 
 		 411 aa  334  1e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  35.95 
 
 		 155 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  31.9 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  31.21 
 
 		 145 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  34.78 
 
 		 158 aa  74.7  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  30.92 
 
 		 156 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  34.64 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  32.92 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  28.19 
 
 		 161 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  31.21 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  31.21 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  30.86 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  32.35 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  32.69 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  31.33 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  26.74 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  29.45 
 
 		 155 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  30.72 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 155 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  31.9 
 
 		 152 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  30.14 
 
 		 150 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1051  regulatory protein RecX  31.21 
 
 		 150 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0599786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0933  regulatory protein RecX  31.21 
 
 		 150 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  33.99 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  33.99 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  29.55 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  33.99 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  33.99 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  33.99 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  33.99 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  33.99 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  32.24 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  32.24 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  27.4 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  27.4 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  28.57 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  31.58 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  26.88 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  28.49 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  31.58 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  27.63 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  30.49 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  27.74 
 
 		 157 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  30.21 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  28.77 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  30.13 
 
 		 166 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  30.13 
 
 		 166 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  32 
 
 		 150 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  26.85 
 
 		 152 aa  55.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  30.13 
 
 		 166 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  30.13 
 
 		 166 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  30.13 
 
 		 166 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  30.13 
 
 		 166 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  30.49 
 
 		 166 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  30.13 
 
 		 166 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  28.12 
 
 		 156 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  28.12 
 
 		 156 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  31.03 
 
 		 153 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  31.1 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  29.87 
 
 		 153 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  28.12 
 
 		 156 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  31.21 
 
 		 153 aa  54.3  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  28.28 
 
 		 137 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2746  regulatory protein RecX  29.49 
 
 		 137 aa  53.9  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  29.24 
 
 		 235 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  28.93 
 
 		 166 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  28.21 
 
 		 153 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  28.3 
 
 		 166 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  28.3 
 
 		 166 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  33.11 
 
 		 150 aa  53.1  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  30.38 
 
 		 149 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  27.81 
 
 		 166 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  28.48 
 
 		 150 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3125  regulatory protein RecX  29.79 
 
 		 137 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  28.74 
 
 		 166 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3116  regulatory protein RecX  29.79 
 
 		 137 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  29.25 
 
 		 153 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3268  regulatory protein RecX  29.79 
 
 		 137 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  30 
 
 		 164 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  27.7 
 
 		 168 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  29.33 
 
 		 148 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  27.74 
 
 		 152 aa  50.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1548  regulatory protein RecX  29.07 
 
 		 172 aa  50.8  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  29.78 
 
 		 166 aa  50.4  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  25.81 
 
 		 159 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  26.97 
 
 		 159 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  25.47 
 
 		 162 aa  49.7  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  30.19 
 
 		 162 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  29.45 
 
 		 138 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  28.48 
 
 		 150 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3955  regulatory protein RecX  27.74 
 
 		 168 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  27.81 
 
 		 151 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  28.81 
 
 		 182 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0873  regulatory protein RecX  25.83 
 
 		 158 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  28.81 
 
 		 187 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  27.81 
 
 		 151 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0528  recombination regulator RecX  27.22 
 
 		 156 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00754387  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  27.15 
 
 		 160 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>