More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2030 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  62.55 
 
 		 238 aa  317  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  64.41 
 
 		 238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 239 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 239 aa  308  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  63.36 
 
 		 238 aa  308  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  63.98 
 
 		 239 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  62.55 
 
 		 238 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  61.73 
 
 		 254 aa  297  9e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  61.64 
 
 		 247 aa  295  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  62.18 
 
 		 252 aa  294  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  62.98 
 
 		 238 aa  291  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  60 
 
 		 237 aa  291  9e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  61.48 
 
 		 246 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  62.13 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  61.48 
 
 		 246 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  61.48 
 
 		 246 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  58.26 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  63.11 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  64.14 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  61.07 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  60.33 
 
 		 244 aa  289  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  61.07 
 
 		 246 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  60.33 
 
 		 244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  61.7 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  61.02 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  61.34 
 
 		 252 aa  286  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  62.13 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  60.25 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  58.3 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  61.47 
 
 		 243 aa  286  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 238 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 256 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  58.12 
 
 		 235 aa  285  4e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  58.12 
 
 		 235 aa  285  4e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  62.56 
 
 		 242 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 239 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  62.56 
 
 		 242 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 239 aa  284  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  60.76 
 
 		 238 aa  284  9e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  59.57 
 
 		 250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7553  ribonuclease PH  61.92 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  62.45 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  61.7 
 
 		 238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  60.92 
 
 		 246 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  57.85 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  60.85 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  57.45 
 
 		 243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 243 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4024  ribonuclease PH  65.64 
 
 		 243 aa  281  6.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 246 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 243 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 243 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 243 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 243 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 243 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 243 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  58.72 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  57.02 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2734  ribonuclease PH  67.29 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0760609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  60 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  64.59 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  62.13 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4763  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  60.76 
 
 		 238 aa  279  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  61.7 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  60.94 
 
 		 252 aa  278  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 239 aa  278  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 239 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  63.4 
 
 		 238 aa  278  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  60.85 
 
 		 244 aa  278  8e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  63.64 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  58.3 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  56.6 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  58.72 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  59.57 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  58.72 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  59.57 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  58.72 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  56.36 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  57.87 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  57.87 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  59.15 
 
 		 239 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  59.58 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1326  ribonuclease PH  63.11 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.777119  hitchhiker  0.000286825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  57.02 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  56.6 
 
 		 242 aa  275  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 257 aa  275  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 253 aa  275  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>