More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1884 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  100 
 
 		 235 aa  473  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  62.61 
 
 		 233 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  62.56 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  58.95 
 
 		 232 aa  272  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  60.55 
 
 		 233 aa  264  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  60.55 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  55 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  53.42 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  48.15 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  51.36 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  47.95 
 
 		 222 aa  205  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  44.2 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  51.56 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  50.45 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.33 
 
 		 511 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  45.07 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.33 
 
 		 511 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  50.45 
 
 		 251 aa  197  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  48.94 
 
 		 243 aa  197  7.999999999999999e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  50 
 
 		 250 aa  197  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  44.59 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  46.3 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  42.73 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  42.73 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  42.73 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  48.34 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  45.21 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.9 
 
 		 527 aa  188  5.999999999999999e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  46.92 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  43.93 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 230 aa  188  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  46.23 
 
 		 230 aa  188  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  45.21 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  47.06 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  45.33 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  45.79 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  45.79 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  44.86 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 221 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  45.79 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  47.03 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  45.79 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  45.79 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  44.75 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  43.32 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  44.75 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  42.34 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  46.51 
 
 		 229 aa  184  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  43.6 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  43.6 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  43.42 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  43.23 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  43.6 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  43.46 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  44.2 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.17 
 
 		 529 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  44.2 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.93 
 
 		 483 aa  182  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  43.86 
 
 		 229 aa  183  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  40.45 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  41.4 
 
 		 219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  44.08 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 217 aa  181  7e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  43.3 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>