247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0673 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4245  peptidase M16C associated domain-containing protein  40.76 
 
 
973 aa  671    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157444  hitchhiker  0.0000000002425 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1478  Peptidase M16C associated domain protein  40.55 
 
 
970 aa  690    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0673  metalloprotease  100 
 
 
985 aa  2018    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1130  peptidase M16-like  37.93 
 
 
970 aa  653    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.827511  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2871  peptidase M16C associated domain-containing protein  40.35 
 
 
987 aa  728    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000230302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1857  putative metalloprotease  39.69 
 
 
983 aa  674    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1643  peptidase M16C associated  42.1 
 
 
972 aa  726    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  normal  0.901695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2936  peptidase M16C associated domain-containing protein  40.99 
 
 
967 aa  646    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0337172  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1885  peptidase M16C associated domain-containing protein  41.23 
 
 
974 aa  671    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32286  predicted protein  39.17 
 
 
1034 aa  663    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.414837  normal  0.522406 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2076  peptidase M16-like  39.67 
 
 
983 aa  627  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2044  peptidase M16C associated domain-containing protein  36.34 
 
 
964 aa  569  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0158  peptidase M16C associated domain-containing protein  34.95 
 
 
968 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0695  peptidase M16C associated domain-containing protein  34.85 
 
 
968 aa  554  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00570537  decreased coverage  0.000127809 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03853  Mitochondrial presequence protease Precursor (EC 3.4.24.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6H7]  35.2 
 
 
1049 aa  547  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901124  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1780  Peptidase M16C associated domain protein  36.86 
 
 
969 aa  546  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126781  normal  0.432438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0490  Peptidase M16C associated domain protein  34.61 
 
 
969 aa  537  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0211  insulinase family metalloprotease  34.94 
 
 
975 aa  534  1e-150  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41654  predicted protein  34.5 
 
 
979 aa  535  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00193617  normal  0.306826 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1842  peptidase M16 familiy  35.08 
 
 
1024 aa  531  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.284572  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2677  PreP peptidase  34.75 
 
 
1046 aa  532  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1843  peptidase M16C associated domain-containing protein  36.13 
 
 
1032 aa  528  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000453364  unclonable  0.00000000218752 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1661  peptidase M16C associated domain-containing protein  34.46 
 
 
976 aa  528  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0645  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.44 
 
 
992 aa  529  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141412  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2129  peptidase M16-like  34.8 
 
 
1025 aa  526  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1365  Peptidase M16C associated domain protein  35.15 
 
 
968 aa  524  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1179  peptidase M16C associated  31.89 
 
 
987 aa  520  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0345  Peptidase M16C associated domain protein  34.54 
 
 
970 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0396626  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1565  Peptidase M16C associated domain protein  34.6 
 
 
968 aa  513  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0498145  normal  0.0547201 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1656  putative peptidase  28.87 
 
 
973 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0884161  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1395  peptidase, putative  28.76 
 
 
973 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131852  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1865  M16 family peptidase  31.12 
 
 
1017 aa  487  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000469623  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_232  predicted protein  32.93 
 
 
986 aa  483  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1217  Peptidase M16C associated domain protein  30.46 
 
 
999 aa  389  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00171078  normal  0.0476077 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76282  predicted protein  32.8 
 
 
1046 aa  381  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.967871  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0378  Peptidase M16C associated domain protein  29.52 
 
 
1010 aa  357  6.999999999999999e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.858415  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20700  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  30.19 
 
 
972 aa  357  7.999999999999999e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04570  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  30.64 
 
 
985 aa  355  2.9999999999999997e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0233  peptidase M16 inactive domain protein  24.49 
 
 
971 aa  339  1.9999999999999998e-91  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.312549  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0197  Peptidase M16C associated domain protein  27.64 
 
 
949 aa  328  4.0000000000000003e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2447  peptidase M16 domain protein  22.51 
 
 
1137 aa  241  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04540  cytoplasm protein, putative  21.55 
 
 
1054 aa  105  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0121322  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84931  predicted protein  22.81 
 
 
1049 aa  82.4  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09434  zinc metalloprotease, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07610)  26.7 
 
 
1057 aa  80.1  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  23.76 
 
 
896 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  23.64 
 
 
937 aa  78.2  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  21.88 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3614  peptidase M16 domain protein  24.56 
 
 
424 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.600859 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  24.93 
 
 
948 aa  72  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  23.13 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  26.36 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4233  peptidase M16 domain protein  24.81 
 
 
424 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00835158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4194  peptidase M16 domain protein  24.81 
 
 
424 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  22.16 
 
 
945 aa  68.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  23.65 
 
 
942 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  25.07 
 
 
921 aa  67.4  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  23.77 
 
 
928 aa  67  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  22.95 
 
 
912 aa  66.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  24.8 
 
 
439 aa  65.1  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  24.71 
 
 
470 aa  64.3  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  23.04 
 
 
934 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  21.8 
 
 
912 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  25.49 
 
 
459 aa  63.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  24.66 
 
 
443 aa  62.4  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  25.55 
 
 
949 aa  61.6  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  24.24 
 
 
427 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  25.07 
 
 
949 aa  61.6  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  24.24 
 
 
427 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1139  M16 family peptidase  22.8 
 
 
413 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  23.92 
 
 
918 aa  60.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  23.74 
 
 
431 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  20.11 
 
 
423 aa  59.3  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  24.59 
 
 
454 aa  58.9  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  22.09 
 
 
441 aa  58.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1032  peptidase M16 domain-containing protein  24.71 
 
 
426 aa  58.5  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.856018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  22.43 
 
 
442 aa  58.2  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  24.23 
 
 
431 aa  57.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  23.7 
 
 
443 aa  57.8  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  22.56 
 
 
419 aa  57.4  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0496  peptidase M16 domain protein  23.85 
 
 
501 aa  57.4  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  23.53 
 
 
957 aa  57.4  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  21.33 
 
 
413 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  21.33 
 
 
413 aa  56.6  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  21.33 
 
 
399 aa  57  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  21.84 
 
 
919 aa  56.6  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  21.61 
 
 
413 aa  56.6  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  21.33 
 
 
413 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  28.19 
 
 
929 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  21.33 
 
 
413 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  21.33 
 
 
413 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  21.33 
 
 
413 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  21.33 
 
 
413 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  21.33 
 
 
413 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  28.19 
 
 
949 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  30.1 
 
 
959 aa  55.8  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  23.66 
 
 
448 aa  55.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2248  peptidase M16 domain-containing protein  25.41 
 
 
647 aa  55.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.082562  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  27.66 
 
 
947 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  26.78 
 
 
482 aa  55.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  22.56 
 
 
419 aa  55.5  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>