More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0660 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0660  cytosine/adenosine deaminase  100 
 
 
193 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0340  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.85 
 
 
196 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2842  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  52.36 
 
 
194 aa  205  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0072  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.44 
 
 
204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.91 
 
 
190 aa  181  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.09 
 
 
190 aa  177  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2498  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.35 
 
 
197 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1808  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.48 
 
 
191 aa  151  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.0647304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0239  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  44.86 
 
 
186 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000722464  hitchhiker  0.0000000000000386131 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0379  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.27 
 
 
201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00104836  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04619  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  40.98 
 
 
186 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0679  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.89 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0160  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.73 
 
 
112 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.58 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7208  predicted protein  39.67 
 
 
123 aa  91.7  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.472899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.81 
 
 
158 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.94 
 
 
158 aa  85.1  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.39 
 
 
163 aa  84.3  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.04 
 
 
160 aa  84.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.5 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.54 
 
 
157 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  38.02 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.48 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.47 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  31.33 
 
 
149 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  32.86 
 
 
154 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  34.33 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  30.32 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.61 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.97 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  29.61 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.68 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.17 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.33 
 
 
164 aa  72  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.18 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.33 
 
 
160 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.44 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  36.61 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.64 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.53 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.38 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  39.64 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  38.53 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.23 
 
 
168 aa  62  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36 
 
 
163 aa  61.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.05 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.81 
 
 
156 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.6 
 
 
163 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  25.61 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.81 
 
 
154 aa  58.9  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.45 
 
 
160 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.52 
 
 
161 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  34.07 
 
 
151 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.86 
 
 
155 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.05 
 
 
161 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  35.11 
 
 
151 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.81 
 
 
155 aa  57.4  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1609  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.4 
 
 
165 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0448042  normal  0.295189 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.63 
 
 
158 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.45 
 
 
161 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.08 
 
 
301 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  35.9 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  29.49 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  28.67 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  30.72 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.12 
 
 
157 aa  55.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  30.13 
 
 
164 aa  54.7  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5394  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.81 
 
 
144 aa  54.7  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.04 
 
 
161 aa  54.7  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  38.26 
 
 
158 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.51 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0136  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  34.34 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  35.97 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  28.79 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.75 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.78 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.87 
 
 
521 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  30.47 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.04 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0027  tRNA-adenosine deaminase  40.54 
 
 
150 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.86 
 
 
156 aa  52.8  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  35.14 
 
 
163 aa  53.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
152 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0619  tRNA-adenosine deaminase  31.25 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.33 
 
 
154 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  28.79 
 
 
157 aa  52.4  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37 
 
 
153 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  27.45 
 
 
158 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0141  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.34 
 
 
157 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  32.84 
 
 
157 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.29 
 
 
151 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.67 
 
 
148 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  34.78 
 
 
148 aa  52  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.14 
 
 
164 aa  52  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.21 
 
 
150 aa  52  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  34.78 
 
 
148 aa  52  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36 
 
 
153 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1476  tRNA-adenosine deaminase  30.53 
 
 
176 aa  51.6  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  36.61 
 
 
177 aa  51.6  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>