More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2166 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_2166  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 
265 aa  519  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0015  band 7 protein  90.87 
 
 
262 aa  443  1e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1055  band 7 protein  90.11 
 
 
275 aa  424  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.525023 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0067  band 7 protein  63.18 
 
 
270 aa  302  4.0000000000000003e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.8 
 
 
257 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  51.15 
 
 
265 aa  226  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.03 
 
 
261 aa  225  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  47.64 
 
 
290 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.44 
 
 
264 aa  222  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  47.25 
 
 
259 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.86 
 
 
252 aa  219  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  46.81 
 
 
254 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.12 
 
 
270 aa  217  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  46.18 
 
 
265 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  46.31 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  46.47 
 
 
267 aa  216  4e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  48.03 
 
 
258 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  44.31 
 
 
248 aa  215  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  48.67 
 
 
248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.8 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  45.76 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  44.14 
 
 
281 aa  212  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  47.68 
 
 
281 aa  211  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.37 
 
 
267 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  42.37 
 
 
267 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  45.17 
 
 
259 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  45.69 
 
 
261 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.76 
 
 
265 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  47.47 
 
 
253 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.15 
 
 
278 aa  205  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  48.26 
 
 
258 aa  205  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  41.41 
 
 
295 aa  205  7e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  45.37 
 
 
274 aa  203  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  44.89 
 
 
254 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  45.92 
 
 
261 aa  202  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  43.16 
 
 
249 aa  201  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  46.7 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  42.97 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  42.97 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.59 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.78 
 
 
259 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  44.35 
 
 
263 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  42.57 
 
 
267 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  40.4 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  43.16 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0620  band 7 protein  45.82 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  43.78 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  43.67 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  41.9 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  42.51 
 
 
258 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.22 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2530  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.87 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1806  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.35 
 
 
256 aa  194  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  43.56 
 
 
256 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  47.19 
 
 
254 aa  193  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  41.28 
 
 
252 aa  193  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1024  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.8 
 
 
260 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.45 
 
 
261 aa  192  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  44.16 
 
 
252 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  43.78 
 
 
257 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.78 
 
 
257 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.75 
 
 
257 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2150  band 7 protein  42.98 
 
 
259 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  43.78 
 
 
257 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  45.37 
 
 
257 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.68 
 
 
257 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.93 
 
 
257 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  42.42 
 
 
270 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  45.41 
 
 
257 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  45.41 
 
 
257 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1161  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.22 
 
 
248 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  39.27 
 
 
275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  43.12 
 
 
259 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  42.06 
 
 
253 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  44.95 
 
 
257 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4388  band 7 protein  44.5 
 
 
257 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  41.2 
 
 
285 aa  188  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  40.85 
 
 
287 aa  188  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.06 
 
 
248 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  39.27 
 
 
263 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  44.5 
 
 
257 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28570  SPFH domain, Band 7 family protein  43.06 
 
 
274 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2659  band 7 protein  45.11 
 
 
266 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37049  normal  0.0645118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1741  SPFH domain, Band 7 family protein  42.55 
 
 
291 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.011683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  41.08 
 
 
252 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  41.47 
 
 
249 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  42.19 
 
 
266 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1164  band 7 protein  44.44 
 
 
263 aa  187  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00105644  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  41.08 
 
 
252 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.7 
 
 
251 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.98 
 
 
257 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4950  band 7 protein  45.41 
 
 
278 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493211  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  39.57 
 
 
278 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  39.68 
 
 
251 aa  185  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4389  band 7 protein  43.15 
 
 
253 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  40.27 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  42.02 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0802  putative stomatin-like transmembrane protein  42.92 
 
 
249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  42.42 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  37.7 
 
 
308 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>