More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1192 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1192  HtpX-2 peptidase  100 
 
 
344 aa  680    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1861  peptidase M48, Ste24p  76.66 
 
 
348 aa  539  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0841  peptidase M48 Ste24p  77.46 
 
 
351 aa  520  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.843942  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0989  peptidase M48, Ste24p  74.78 
 
 
347 aa  494  1e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.230261 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1643  peptidase M48, Ste24p  50.15 
 
 
337 aa  297  2e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.691275 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1218  peptidase M48, Ste24p  43.22 
 
 
372 aa  200  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.416464  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0519  heat shock protein HtpX  31.83 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.287918  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0242  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 
319 aa  129  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.61908 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0965  peptidase M48 Ste24p  33.45 
 
 
325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2626  peptidase M48 Ste24p  32.32 
 
 
311 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0270416  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  32.99 
 
 
284 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  31.79 
 
 
296 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  30.74 
 
 
285 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  32.19 
 
 
283 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  35.74 
 
 
283 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  33.7 
 
 
308 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1012  peptidase M48, Ste24p  29.45 
 
 
310 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00402297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  29.87 
 
 
286 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  30.71 
 
 
287 aa  99.4  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  29.37 
 
 
312 aa  99.4  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  29.92 
 
 
282 aa  99  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  31.09 
 
 
291 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  31.09 
 
 
291 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  31.09 
 
 
291 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  32.21 
 
 
286 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  34.94 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1154  peptidase M48 Ste24p  27.19 
 
 
587 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.997674  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  33.47 
 
 
289 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  33.33 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  30.39 
 
 
285 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  32.03 
 
 
298 aa  96.7  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  30.29 
 
 
293 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  27.96 
 
 
285 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  27.96 
 
 
285 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  30.36 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  30.13 
 
 
297 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  29.78 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  31.48 
 
 
280 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  28.57 
 
 
285 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  28.57 
 
 
285 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  28.57 
 
 
285 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  27.78 
 
 
285 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  28.57 
 
 
285 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  29.74 
 
 
303 aa  94.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  28.57 
 
 
285 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  28.57 
 
 
285 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  27.78 
 
 
285 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  28.57 
 
 
285 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  27.78 
 
 
285 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  32.27 
 
 
299 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  31.6 
 
 
397 aa  93.6  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  29.62 
 
 
280 aa  93.2  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  32.38 
 
 
296 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  29.87 
 
 
288 aa  93.2  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  30.23 
 
 
287 aa  93.2  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  32.88 
 
 
286 aa  92.8  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  27.78 
 
 
285 aa  92.8  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  28.15 
 
 
285 aa  92.8  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  28.67 
 
 
286 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  28.33 
 
 
286 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  30.4 
 
 
285 aa  92.8  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  30.77 
 
 
285 aa  93.2  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  28.9 
 
 
282 aa  92.8  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  29.7 
 
 
296 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 
274 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  29.04 
 
 
285 aa  92  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0566  peptidase M48 Ste24p  27.3 
 
 
669 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1008  heat shock protein HtpX  33.23 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6245  peptidase M48 Ste24p  27.67 
 
 
549 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632873  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  27.96 
 
 
307 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  27.12 
 
 
285 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  31.71 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  31.09 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  32.12 
 
 
290 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  31.84 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  28.63 
 
 
281 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  29.59 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  29.89 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  29.62 
 
 
316 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  29.49 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0549  peptidase M48 Ste24p  27.3 
 
 
669 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  29.71 
 
 
285 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1586  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 
268 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.808778  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  27.69 
 
 
306 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  29.87 
 
 
285 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  30.45 
 
 
292 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  29.96 
 
 
286 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2018  HtpX-2 peptidase  34.07 
 
 
299 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  28.24 
 
 
291 aa  89.4  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0199  peptidase M48, Ste24p  31.94 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  31.25 
 
 
397 aa  89  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  32.26 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2658  peptidase M48, Ste24p  31.21 
 
 
301 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  30.18 
 
 
343 aa  89  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  27.12 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  31.64 
 
 
307 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  31.64 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  29.87 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  32.38 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  31.09 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>