More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0176 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  100 
 
 		 130 aa  259  8.999999999999999e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  90.77 
 
 		 130 aa  241  1.9999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  91.54 
 
 		 130 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  89.23 
 
 		 130 aa  238  1e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  70.77 
 
 		 130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  60.47 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  52.71 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  55.38 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 133 aa  146  9e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  50.77 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  51.54 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  51.54 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  48.87 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  47.69 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  49.23 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  50.79 
 
 		 129 aa  136  8.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  47.69 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  46.15 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  49.23 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  44.62 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  44.62 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  44.62 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  46.15 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  43.85 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  45.38 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  46.92 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  43.85 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  43.85 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  44.62 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  41.54 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  43.08 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  41.54 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  33.08 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  33.82 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  31.88 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1855  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  30.28 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  32.39 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  31.69 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0712  30S ribosomal protein S8  32.39 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  32.39 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  28.28 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1346  30S ribosomal protein S8  30.28 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000055965  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1444  30S ribosomal protein S8  30.28 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  31.88 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  31.16 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  31.69 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  28.47 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  31.58 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  30.99 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17271  30S ribosomal protein S8  34.07 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  30.5 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0440  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106924  hitchhiker  0.0000987465 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  30.15 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  34.35 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1263  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476198  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2804  30S ribosomal protein S8  31.76 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.804499  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1339  30S ribosomal protein S8  27.4 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0927  ribosomal protein S8  30.15 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000726812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1637  30S ribosomal protein S8  31.85 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17361  30S ribosomal protein S8  31.85 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  33.33 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  32.12 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2750  ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0659049  normal  0.320849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4784  30S ribosomal protein S8  32.33 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00859793  hitchhiker  0.0000000067379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0268  30S ribosomal protein S8  29.08 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0501606  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  32.33 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1404  ribosomal protein S8  32.12 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  29.71 
 
 		 133 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  26.76 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1000  30S ribosomal protein S8  28.87 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361404  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1840  30S ribosomal protein S8  32.88 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  30.88 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0733  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00108537  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17521  30S ribosomal protein S8  29.86 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  32.58 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2310  ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000043435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  30.37 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  26.81 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2155  ribosomal protein S8  35.04 
 
 		 130 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0746711  normal  0.328935 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0351  30S ribosomal protein S8  31.51 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000194247  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2520  30S ribosomal protein S8  30.56 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  26.76 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  26.76 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>