More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1404 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1404  ribosomal protein S8  100 
 
 
130 aa  267  5e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  56.59 
 
 
132 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  55.38 
 
 
136 aa  153  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  55.81 
 
 
132 aa  152  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  55.81 
 
 
134 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  52.71 
 
 
130 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  54.26 
 
 
132 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  55.81 
 
 
132 aa  151  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  55.04 
 
 
131 aa  150  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  55.04 
 
 
133 aa  149  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 
132 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  54.26 
 
 
132 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  51.16 
 
 
132 aa  148  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  53.49 
 
 
133 aa  147  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 
132 aa  147  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  53.49 
 
 
132 aa  146  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  52.71 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  51.16 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 
132 aa  144  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 
132 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 
132 aa  144  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 
132 aa  144  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 
132 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 
132 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 
132 aa  144  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 
132 aa  144  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 
132 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 
132 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 
132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  55.04 
 
 
132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  51.16 
 
 
132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 
132 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 
132 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 
130 aa  142  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 
132 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  141  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 
132 aa  141  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  51.16 
 
 
132 aa  140  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  50.39 
 
 
131 aa  140  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 
132 aa  139  9e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  51.16 
 
 
133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  51.16 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  51.16 
 
 
132 aa  138  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  48.06 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 
132 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0781  30S ribosomal protein S8  51.16 
 
 
132 aa  135  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00525969  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2893  ribosomal protein S8  50.39 
 
 
131 aa  135  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  50.39 
 
 
132 aa  135  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  49.61 
 
 
132 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0927  ribosomal protein S8  50.39 
 
 
133 aa  134  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000726812  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  49.61 
 
 
132 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  50.39 
 
 
131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  49.61 
 
 
132 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  51.16 
 
 
131 aa  133  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  48.09 
 
 
135 aa  132  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  47.29 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 
133 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  51.16 
 
 
131 aa  131  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 
132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  48.84 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0212  ribosomal protein S8  50.39 
 
 
130 aa  130  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  49.61 
 
 
132 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  48.06 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0640  ribosomal protein S8  51.16 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000305932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4534  30S ribosomal protein S8  51.16 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000327382  normal  0.123392 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  47.29 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  47.29 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  47.29 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  47.29 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  48.06 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5065  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 
130 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000451262  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
132 aa  128  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  49.23 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 
131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  44.96 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3129  ribosomal protein S8  45.74 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4735  30S ribosomal protein S8  51.16 
 
 
130 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000117347  normal  0.480985 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0093  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 
126 aa  127  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
132 aa  127  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  48.06 
 
 
132 aa  127  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  47.29 
 
 
132 aa  127  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1137  ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>