More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0212 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0212  ribosomal protein S8  100 
 
 		 130 aa  267  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  49.23 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  52.24 
 
 		 136 aa  137  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1751  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327993  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2243  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0125456  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0773  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590694  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  50.39 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0674  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.973515  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 132 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  53.44 
 
 		 132 aa  133  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1339  30S ribosomal protein S8  48.46 
 
 		 131 aa  133  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0093  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  49.25 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  49.25 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  53.44 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  51.15 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2310  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 131 aa  130  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1404  ribosomal protein S8  50.39 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0268  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0501606  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0277  30S ribosomal protein S8  45.19 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00362239  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1840  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0351  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000194247  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3324  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1970  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00042719  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0472  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00744  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  49.61 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000752194  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  49.61 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  48.48 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  49.61 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4784  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00859793  hitchhiker  0.0000000067379 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1182  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.358375  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1219  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1922  ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 131 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0605  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2160  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1000  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 132 aa  126  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361404  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0927  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 133 aa  126  8.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000726812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1855  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 132 aa  126  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  48.46 
 
 		 133 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 132 aa  126  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2520  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 132 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  48.46 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1932  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2980  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  47.29 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001728  SSU ribosomal protein S8p (S15Ae)  50.39 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000120739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0293  SSU ribosomal protein S8P  48.84 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000301121  hitchhiker  0.00000201574 
 
 
 
NC_013235  Namu_1137  ribosomal protein S8  51.15 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0375  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1729  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4303  30S ribosomal protein S8  47.29 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000012409  unclonable  0.0000000000562401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1664  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0768138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  51.15 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0339  ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  47.37 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3653  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  46.56 
 
 		 133 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2309  30S ribosomal protein S8  44.53 
 
 		 132 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0143917  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3170  30S ribosomal protein S8  44.53 
 
 		 132 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.454242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 		 133 aa  123  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 131 aa  123  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  45.04 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>