More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2243 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2243  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
126 aa  256  7e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0125456  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0093  30S ribosomal protein S8  84.13 
 
 
126 aa  221  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407651 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1751  30S ribosomal protein S8  80.16 
 
 
126 aa  209  9e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327993  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0674  30S ribosomal protein S8  79.37 
 
 
126 aa  208  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.973515  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2760  30S ribosomal protein S8  62.6 
 
 
127 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000679663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2051  30S ribosomal protein S8  61.6 
 
 
127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00264712  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  57.69 
 
 
132 aa  147  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 
130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  56.59 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  58.02 
 
 
131 aa  144  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  54.76 
 
 
131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000752194  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  54.62 
 
 
132 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  54.96 
 
 
131 aa  141  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  58.78 
 
 
133 aa  140  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  53.17 
 
 
131 aa  140  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  54.26 
 
 
131 aa  140  6e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  55.38 
 
 
132 aa  140  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  55.81 
 
 
129 aa  140  7e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  53.6 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  56.15 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  55.73 
 
 
131 aa  138  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
130 aa  138  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  55.73 
 
 
134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  53.85 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0682  30S ribosomal protein S8  57.36 
 
 
129 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0212  ribosomal protein S8  49.23 
 
 
130 aa  136  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  53.44 
 
 
132 aa  136  8.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0640  ribosomal protein S8  50.78 
 
 
130 aa  135  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000305932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4534  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
130 aa  135  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000327382  normal  0.123392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 
132 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  52.31 
 
 
132 aa  136  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  55.38 
 
 
132 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08990  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
130 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000305934  normal  0.17912 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000315626  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 
132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 
132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 
132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 
132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  49.22 
 
 
131 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3324  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  134  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  134  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1339  30S ribosomal protein S8  51.16 
 
 
131 aa  134  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0851  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000583772  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0781  ribosomal protein S8  51.59 
 
 
131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000256719  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0770  30S ribosomal protein S8  51.97 
 
 
132 aa  133  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.049997  normal  0.0124974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2520  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
132 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 
132 aa  133  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1729  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 
132 aa  133  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 
132 aa  133  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0375  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 
132 aa  133  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  133  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  50.77 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2310  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  53.08 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0293  SSU ribosomal protein S8P  50.79 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000301121  hitchhiker  0.00000201574 
 
 
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0468  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00000537928  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2155  ribosomal protein S8  43.85 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0746711  normal  0.328935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0501  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000611084  normal  0.097534 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0498  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000149249  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  48.12 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  48.03 
 
 
130 aa  131  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 
132 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 
132 aa  131  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  46.46 
 
 
130 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  54.62 
 
 
132 aa  131  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1781  SSU ribosomal protein S8P  52.71 
 
 
132 aa  131  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0284489  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4735  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
130 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000117347  normal  0.480985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  53.44 
 
 
132 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3935  ribosomal protein S8  47.66 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  53.08 
 
 
132 aa  130  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  48.15 
 
 
134 aa  130  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>