More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0781 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0781  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 132 aa  269  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00525969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0503  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  52.59 
 
 		 136 aa  143  9e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  46.97 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  141  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 132 aa  139  9e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 		 133 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1404  ribosomal protein S8  51.16 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1751  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327993  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  50 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  48.15 
 
 		 135 aa  134  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  49.25 
 
 		 134 aa  133  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  133  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  133  9e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  48.46 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  48.48 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2893  ribosomal protein S8  51.94 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0383  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.987697  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  51.45 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0674  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.973515  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1853  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.923356 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  46.15 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1161  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000284312  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000752194  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  49.24 
 
 		 132 aa  130  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  130  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  127  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2605  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000206402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0093  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3324  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1850  ribosomal protein S8  50.75 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.84535e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2358  ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2674  30S ribosomal protein S8  46.62 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.169773  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0293  SSU ribosomal protein S8P  50.38 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000301121  hitchhiker  0.00000201574 
 
 
 
NC_008576  Mmc1_0861  SSU ribosomal protein S8P  48.87 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118067  hitchhiker  0.00176948 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2760  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000679663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  46.62 
 
 		 133 aa  123  6e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2980  30S ribosomal protein S8  45.11 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 131 aa  123  7e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2243  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0125456  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 132 aa  123  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 132 aa  123  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>