More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1853 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1853  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 133 aa  266  5e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.923356 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2605  30S ribosomal protein S8  72.93 
 
 		 131 aa  201  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000206402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2893  ribosomal protein S8  64.66 
 
 		 131 aa  177  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  55.15 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  55.3 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  54.07 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  54.55 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1147  ribosomal protein S8  55.22 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000686706  hitchhiker  0.00453997 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0491  ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.263273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  52.27 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  51.47 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0596  30S ribosomal protein S8  52.24 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0320  SSU ribosomal protein S8P  54.07 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355814 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  50.75 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 133 aa  140  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  52.94 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  52.94 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  52.24 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  48.87 
 
 		 132 aa  136  7.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 132 aa  136  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  45.86 
 
 		 132 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  48.87 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  46.62 
 
 		 133 aa  133  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6035  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 135 aa  133  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 132 aa  133  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  133  8e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  51.13 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  46.32 
 
 		 134 aa  133  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  50 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3129  ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  50 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0781  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00525969  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2674  30S ribosomal protein S8  48.87 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 135 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  48.87 
 
 		 132 aa  129  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0277  30S ribosomal protein S8  47.45 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00362239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1161  30S ribosomal protein S8  47.14 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000284312  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0334  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000236228  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  46.62 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>