More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0128 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 334 aa  665    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  85.84 
 
 		 334 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  85.5 
 
 		 332 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  83.53 
 
 		 334 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  64.56 
 
 		 336 aa  451  1e-125  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  56.29 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  51.94 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  51.36 
 
 		 333 aa  348  7e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  48.8 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  47.32 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  47.16 
 
 		 337 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  47.46 
 
 		 337 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  43.07 
 
 		 336 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  44.74 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  43.84 
 
 		 350 aa  276  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  42.64 
 
 		 337 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  44.48 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  43.54 
 
 		 346 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  41.77 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  32.47 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  32.47 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2004  adenylosuccinate synthase  34.29 
 
 		 561 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00819563  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  31.79 
 
 		 444 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  35.85 
 
 		 550 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0610  Adenylosuccinate synthase  35.47 
 
 		 507 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278665  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  30.63 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  31.58 
 
 		 423 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  34.35 
 
 		 427 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0403  adenylosuccinate synthetase  31.41 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.841501 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  29.55 
 
 		 435 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  30.73 
 
 		 428 aa  162  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  29.55 
 
 		 435 aa  162  8.000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  31.49 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  31.08 
 
 		 434 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  30.6 
 
 		 431 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  31.22 
 
 		 431 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  31.49 
 
 		 432 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  31.49 
 
 		 432 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  29.11 
 
 		 432 aa  159  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  29.98 
 
 		 427 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  31.31 
 
 		 430 aa  158  9e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  31.49 
 
 		 432 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  29.64 
 
 		 433 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  32.79 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  30.61 
 
 		 430 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  29.95 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  31.6 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  29.93 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  31.24 
 
 		 431 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  30.12 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  31.07 
 
 		 430 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  28.87 
 
 		 432 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  32.39 
 
 		 432 aa  156  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  30.82 
 
 		 431 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  29.34 
 
 		 431 aa  155  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  31.44 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  31.28 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  31.18 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  30.75 
 
 		 427 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  30.42 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  29.88 
 
 		 430 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  32.61 
 
 		 427 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  30.44 
 
 		 430 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0677  adenylosuccinate synthetase  30.26 
 
 		 429 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  29.65 
 
 		 430 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  30.37 
 
 		 431 aa  152  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  32.01 
 
 		 432 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  28.19 
 
 		 424 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  32.01 
 
 		 432 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  32.01 
 
 		 432 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  29.79 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  30.84 
 
 		 448 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  30.84 
 
 		 430 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  32.01 
 
 		 432 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  32.01 
 
 		 432 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  32.01 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  32.01 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  32.01 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  32.01 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  32.01 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  32.01 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  30.84 
 
 		 430 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  32.01 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  32.01 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  32.01 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  29.3 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  28.3 
 
 		 430 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  29.23 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  29.23 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  29.76 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  29.86 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  29.79 
 
 		 437 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  30.12 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  29.81 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  30.53 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  30.75 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3013  adenylosuccinate synthetase  30.5 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220071  normal  0.0269955 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  30.22 
 
 		 430 aa  149  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  29.22 
 
 		 425 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>