93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3862 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3862  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  583  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001101  membrane protein  49.49 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0693  hypothetical protein  50 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2783  hypothetical protein  49.14 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04844  hypothetical protein  48.46 
 
 		 305 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0036  membrane protein  50.55 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0094  hypothetical protein  51.88 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000305828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3073  hypothetical protein  48.97 
 
 		 304 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3082  hypothetical protein  48.28 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3225  hypothetical protein  48.62 
 
 		 304 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2975  hypothetical protein  48.62 
 
 		 304 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2796  hypothetical protein  48.28 
 
 		 304 aa  271  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2879  hypothetical protein  48.28 
 
 		 304 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1294  protein of unknown function DUF368  47.93 
 
 		 304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1206  hypothetical protein  48.28 
 
 		 304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1107  hypothetical protein  47.2 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1400  hypothetical protein  47.93 
 
 		 292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0960  hypothetical protein  48.25 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1038  hypothetical protein  47.84 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.246357  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06740  integral membrane protein  46.55 
 
 		 307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1251  membrane protein  47.55 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3022  hypothetical protein  51.14 
 
 		 312 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0149  protein of unknown function DUF368  44.93 
 
 		 332 aa  255  7e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0703  protein of unknown function DUF368  49.3 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0930  hypothetical protein  46.42 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3040  hypothetical protein  46.94 
 
 		 309 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0928  hypothetical protein  42.66 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2840  hypothetical protein  43.9 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1306  hypothetical protein  48.24 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2633  hypothetical protein  42.12 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1811  protein of unknown function DUF368  45.8 
 
 		 317 aa  215  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1858  hypothetical protein  46.77 
 
 		 341 aa  215  9e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2147  hypothetical protein  45.38 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2001  hypothetical protein  46.96 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3873  hypothetical protein  40.65 
 
 		 330 aa  205  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0943  hypothetical protein  41.73 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0196129  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2007  hypothetical protein  44.79 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00601803  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1640  hypothetical protein  39.1 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06735  Predicted membrane protein  33.23 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260385  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0809  hypothetical protein  39.17 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0473658  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0156  protein of unknown function DUF368  40 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1921  protein of unknown function DUF368  37.45 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0446  hypothetical protein  38.77 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  39.92 
 
 		 565 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0704  hypothetical protein  40.09 
 
 		 290 aa  142  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.527193  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2809  protein of unknown function DUF368  35.47 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0387  protein of unknown function DUF368  33.06 
 
 		 320 aa  132  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1638  hypothetical protein  37.29 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24370  predicted membrane protein  30.8 
 
 		 355 aa  122  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0784  hypothetical protein  35.86 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0761  hypothetical protein  36.82 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20100  predicted membrane protein  30.08 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00191645  normal  0.0169787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2958  protein of unknown function DUF368  33.33 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2249  hypothetical protein  32.92 
 
 		 319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1061  protein of unknown function DUF368  31.87 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0607  protein of unknown function DUF368  31.97 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0288  protein of unknown function DUF368  31.64 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3629  protein of unknown function DUF368  36.22 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3700  hypothetical protein  32.78 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.435623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4950  hypothetical protein  30.29 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5261  hypothetical protein  31.54 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5006  hypothetical protein  31.54 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4850  hypothetical protein  31.54 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5242  hypothetical protein  31.54 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5681  hypothetical protein  31.54 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5276  hypothetical protein  31.54 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.348652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5318  hypothetical protein  31.54 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4835  hypothetical protein  31.54 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2510  hypothetical protein  29.92 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000712046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5386  hypothetical protein  31.54 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5992  protein of unknown function DUF368  35 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0495  hypothetical protein  34.94 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.322978  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0858  hypothetical protein  31.85 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0888  protein of unknown function DUF368  30.17 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0842  hypothetical protein  31.85 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0142899  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1029  hypothetical protein  30.08 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2829  protein of unknown function DUF368  32.31 
 
 		 320 aa  89.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0644  hypothetical protein  26.07 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0540677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1628  hypothetical protein  30.92 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1370  hypothetical protein  30.53 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2501  protein of unknown function DUF368  31.66 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0838  hypothetical protein  29.55 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1575  protein of unknown function DUF368  28.28 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1873  protein of unknown function DUF368  25.94 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000015734  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2250  hypothetical protein  30.86 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2358  protein of unknown function DUF368  30.68 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115253  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0717  hypothetical protein  28.57 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3492  hypothetical protein  27.63 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0279106  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1718  hypothetical protein  31.37 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0787  hypothetical protein  28.7 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2720  membrane protein-like protein  33.86 
 
 		 183 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0187  protein of unknown function DUF368  24.9 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1472  hypothetical protein  27.7 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.248471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>