22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1962 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1962  peptidylglycine monooxygenase-like  100 
 
 		 375 aa  779    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  65.24 
 
 		 372 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  58.81 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  42.44 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  35.46 
 
 		 367 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2067  NHL repeat containing protein  24.1 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4420  NHL repeat containing protein  25.61 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  24.38 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  25.21 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  23.89 
 
 		 328 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  23.51 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  24.15 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  23.23 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  23.08 
 
 		 930 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  24.04 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  23.53 
 
 		 588 aa  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  31.46 
 
 		 322 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  26.63 
 
 		 660 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  24.58 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  21.86 
 
 		 1146 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  23.4 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  25.28 
 
 		 418 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>