More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1096 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  100 
 
 
614 aa  1254    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  48.22 
 
 
625 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  40.16 
 
 
642 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  38.28 
 
 
647 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  34.45 
 
 
652 aa  324  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  47.99 
 
 
627 aa  309  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  45.65 
 
 
628 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  32.92 
 
 
691 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  37.06 
 
 
626 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  30.7 
 
 
695 aa  260  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02454  acyltransferase 3  52.94 
 
 
204 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0607875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  30.91 
 
 
684 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  30.45 
 
 
695 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  29.33 
 
 
651 aa  243  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  31.55 
 
 
665 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  29.67 
 
 
629 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  32.2 
 
 
662 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  31.52 
 
 
640 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  29.12 
 
 
647 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  29.22 
 
 
673 aa  223  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  30.31 
 
 
662 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  32.42 
 
 
660 aa  219  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  36.34 
 
 
632 aa  219  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  43.14 
 
 
642 aa  218  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  29.33 
 
 
629 aa  218  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  28.85 
 
 
645 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  33.06 
 
 
658 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.57 
 
 
656 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  29.05 
 
 
635 aa  210  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  29.38 
 
 
629 aa  209  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  28.35 
 
 
667 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  31.53 
 
 
662 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  28.91 
 
 
665 aa  207  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  30.63 
 
 
759 aa  204  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  29.21 
 
 
660 aa  200  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  28.45 
 
 
690 aa  200  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  33.33 
 
 
643 aa  199  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  28.53 
 
 
645 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  36.45 
 
 
675 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  33.27 
 
 
639 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  30.29 
 
 
635 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  29.63 
 
 
660 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  29.62 
 
 
679 aa  194  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  27.51 
 
 
675 aa  194  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  41.22 
 
 
647 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  32.63 
 
 
637 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  35.14 
 
 
695 aa  192  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  26.93 
 
 
660 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  27.66 
 
 
671 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  32.39 
 
 
634 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  27.87 
 
 
683 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  27.55 
 
 
656 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  25.48 
 
 
690 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  37.5 
 
 
630 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  30.65 
 
 
636 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  30.58 
 
 
654 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  33.62 
 
 
621 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  37.7 
 
 
678 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  26.05 
 
 
657 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  27.56 
 
 
660 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  34.31 
 
 
679 aa  177  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  28.83 
 
 
638 aa  177  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  26.05 
 
 
657 aa  176  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  31.12 
 
 
675 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  36.6 
 
 
688 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  24.92 
 
 
695 aa  171  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  28.28 
 
 
690 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.71 
 
 
616 aa  169  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  35.17 
 
 
644 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  25.88 
 
 
696 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  29.59 
 
 
675 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  31.91 
 
 
583 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  31.23 
 
 
716 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  28.08 
 
 
615 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  36.91 
 
 
690 aa  164  5.0000000000000005e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  32.18 
 
 
711 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  26.92 
 
 
715 aa  161  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  36.58 
 
 
658 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  36.94 
 
 
726 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  36.94 
 
 
726 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  36.94 
 
 
726 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  31.47 
 
 
777 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  34.94 
 
 
685 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  30.68 
 
 
598 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  35.71 
 
 
718 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  34.01 
 
 
681 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  33.13 
 
 
603 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  26.13 
 
 
658 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  25.38 
 
 
658 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  34.64 
 
 
632 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  35.16 
 
 
679 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  33.55 
 
 
720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  26.84 
 
 
622 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  25.57 
 
 
742 aa  147  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  34.24 
 
 
682 aa  147  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  31.3 
 
 
603 aa  146  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  31.3 
 
 
603 aa  146  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  25.45 
 
 
675 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  25.39 
 
 
710 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  25.39 
 
 
710 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>