65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1759 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  100 
 
 		 153 aa  298  1e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  95.95 
 
 		 151 aa  281  3.0000000000000004e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  91.95 
 
 		 169 aa  275  2e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  95.24 
 
 		 149 aa  243  6e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  62.76 
 
 		 164 aa  201  4e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  72 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  59.2 
 
 		 130 aa  157  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  60.98 
 
 		 125 aa  157  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  59.17 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  52.07 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  52.94 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  50.42 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  54.7 
 
 		 121 aa  134  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  52.94 
 
 		 120 aa  134  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  51.28 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  50.43 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  47.41 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  48.28 
 
 		 120 aa  127  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  47.01 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  50 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.197581 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  53.39 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  47.9 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.718255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  48.7 
 
 		 120 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  47.01 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  47.01 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  49.58 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  47.01 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  45.38 
 
 		 122 aa  111  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  44.94 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  41.82 
 
 		 127 aa  90.9  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  41.35 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  41.49 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01319  snRNP and snoRNP protein (Snu13), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05950)  46.84 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41236  predicted protein  41.35 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  38.75 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26963  60S ribosomal protein L7A  43.18 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36743  predicted protein  38.36 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931628  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86627  ribosomal protein L8B (L4B) (rp6) (YL5)  42.05 
 
 		 261 aa  61.2  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0378292  normal  0.472149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  47.83 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41276  Ribosomal protein L7a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.08 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  41.98 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05520  cytosolic large ribosomal subunit protein L7A (AFU_orthologue; AFUA_6G12990)  37.11 
 
 		 264 aa  57.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.32412 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  39.13 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01710  nucleolar protein family A member 2, putative  34.19 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  31.13 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02040  ribosomal protein L4, putative  44.93 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23079  predicted protein  44.44 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.740425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2726  50S ribosomal protein L7AE  40.96 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000168835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2466  50S ribosomal protein L7AE  39.13 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1530  hypothetical protein  39.47 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0101  putative ribosomal protein L7Ae-like  40 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0219  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.14 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000001803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0105  putative ribosomal protein L7Ae-like  40 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000154657  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0302  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.37 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0525358  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0316  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.37 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0280  putative ribosomal protein L7Ae-like protein  40.58 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000500453  decreased coverage  0.00000955735 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01110  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.68 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000450722  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0456  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  27.38 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0031  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.84 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2339  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.03 
 
 		 86 aa  42.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000362211  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0320  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.74 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259957  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.29 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8686  predicted protein  28.87 
 
 		 116 aa  41.2  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  28.69 
 
 		 215 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12596  Ribosomal protein S12, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  32.79 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.727796  normal  0.5347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>