More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1643 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1643  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
337 aa  665    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.691275 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1861  peptidase M48, Ste24p  48.27 
 
 
348 aa  300  3e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1192  HtpX-2 peptidase  51.04 
 
 
344 aa  291  1e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0841  peptidase M48 Ste24p  47.54 
 
 
351 aa  270  2e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.843942  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0989  peptidase M48, Ste24p  49.28 
 
 
347 aa  270  2e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.230261 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1218  peptidase M48, Ste24p  42.69 
 
 
372 aa  181  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.416464  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0242  heat shock protein HtpX  36.07 
 
 
319 aa  142  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.61908 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0965  peptidase M48 Ste24p  32.62 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0519  heat shock protein HtpX  32.84 
 
 
334 aa  119  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.287918  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2626  peptidase M48 Ste24p  32.45 
 
 
311 aa  112  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0270416  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1012  peptidase M48, Ste24p  33.58 
 
 
310 aa  103  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00402297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2272  HtpX domain-containing protein  28.57 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  30.17 
 
 
285 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  34.87 
 
 
281 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  31.38 
 
 
286 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  30.99 
 
 
296 aa  92  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  30.96 
 
 
318 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  31.29 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1383  heat shock protein HtpX  29.47 
 
 
294 aa  89.7  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4018  heat shock protein HtpX  30.25 
 
 
291 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000275488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  31.33 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  29.77 
 
 
297 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  31.33 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  31.33 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0377  heat shock protein HtpX  29.97 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  35.06 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  31.2 
 
 
397 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2120  heat shock protein HtpX  31.73 
 
 
292 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000401821  hitchhiker  0.0000953283 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  34.31 
 
 
287 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  31.22 
 
 
290 aa  86.7  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  31.58 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  35.15 
 
 
293 aa  86.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  30.99 
 
 
283 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  29.46 
 
 
286 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  31.54 
 
 
282 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2215  peptidase M48, Ste24p  34.46 
 
 
303 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6245  peptidase M48 Ste24p  29.73 
 
 
549 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632873  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  35.15 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1347  heat shock protein HtpX  30.3 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1784  heat shock protein HtpX  30.62 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000381435  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1674  heat shock protein HtpX  30.62 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00952626  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2662  heat shock protein HtpX  30.62 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000479868  hitchhiker  0.00874622 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1255  heat shock protein HtpX  32.54 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  35.92 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  36.2 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1626  heat shock protein HtpX  30.74 
 
 
298 aa  84  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2658  peptidase M48, Ste24p  30.45 
 
 
301 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1805  heat shock protein HtpX  31.17 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00990556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1443  heat shock protein HtpX  30.89 
 
 
296 aa  84  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000816219  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  35.08 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  34.83 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  32.02 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4316  heat shock protein HtpX  32.86 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.118481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  31.33 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2334  heat shock protein HtpX  32.7 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140813  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2595  heat shock protein HtpX  30.36 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000042859  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  29.57 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2728  heat shock protein HtpX  30.58 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1008  heat shock protein HtpX  32.52 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242477  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  30.3 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  32.22 
 
 
280 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2532  heat shock protein HtpX  34.82 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2118  heat shock protein HtpX  31.1 
 
 
295 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0280256  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  33.19 
 
 
308 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01813  heat shock protein HtpX  27.55 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  30.13 
 
 
285 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  30.92 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2399  heat shock protein HtpX  28.98 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.792526  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  30.86 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  33.17 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1032  heat shock protein HtpX  32.11 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.0829587 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2351  heat shock protein HtpX  30.58 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133306  decreased coverage  0.000000000558904 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2423  heat shock protein HtpX  30.58 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000296306  decreased coverage  0.000159702 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  32.72 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2512  heat shock protein HtpX  30.58 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000804246  hitchhiker  0.00000000151109 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  30.82 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1774  HtpX domain-containing protein  29.08 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  30.24 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  29.96 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1787  heat shock protein HtpX  30.36 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000109217  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2672  heat shock protein HtpX  30.36 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000024307  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2557  heat shock protein HtpX  30.36 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000224131  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  30.18 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3448  heat shock protein HtpX  31.9 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  30.07 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  29.35 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3512  heat shock protein HtpX  31.67 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465022  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  34.47 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  29.36 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  31.93 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1947  HtpX domain protein  30.48 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00129769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  31.65 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2900  peptidase M48, Ste24p  31.1 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1388  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  31.78 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1282  peptidase M48 Ste24p  35.68 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1987  heat shock protein HtpX  30.62 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1983  heat shock protein HtpX  30.62 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  0.0234339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2045  heat shock protein HtpX  30.62 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1287  heat shock protein HtpX  30.62 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000384328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>