More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0159 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0159  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
337 aa  682    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0150  aminotransferase class I and II  72.46 
 
 
335 aa  508  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.646284  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1212  aminotransferase, class I and II  68.56 
 
 
335 aa  501  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0133  histidinol phosphate aminotransferase  72.92 
 
 
357 aa  500  1e-140  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1410  aminotransferase class I and II  43.75 
 
 
353 aa  270  2e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 
351 aa  155  8e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  30.93 
 
 
371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  29.39 
 
 
357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  29.22 
 
 
353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  28.79 
 
 
355 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 
358 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  27.83 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  29.43 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  27.49 
 
 
382 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  28.48 
 
 
355 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  27.49 
 
 
382 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  29.59 
 
 
357 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  27.49 
 
 
382 aa  126  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  28.52 
 
 
349 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
357 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  28.44 
 
 
356 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  28.14 
 
 
356 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  28.14 
 
 
356 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  28.14 
 
 
356 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  28.14 
 
 
356 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  28.14 
 
 
356 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  28.14 
 
 
356 aa  123  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  29.72 
 
 
356 aa  122  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  27.03 
 
 
359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  27.33 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  29.07 
 
 
370 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  27.63 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  27.03 
 
 
359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  27.03 
 
 
359 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  27.03 
 
 
359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  27.84 
 
 
356 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  28.26 
 
 
351 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  26.27 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  28.09 
 
 
350 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  25.93 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  26.24 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  25.07 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  28.12 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  26.81 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  25.9 
 
 
360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  27.52 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  27.79 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  30.91 
 
 
363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  26.9 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  26.49 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  27.76 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  28.82 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  31.35 
 
 
402 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  26.24 
 
 
356 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  28.95 
 
 
365 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  26.59 
 
 
346 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  24.33 
 
 
350 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  30.21 
 
 
371 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  30.31 
 
 
367 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  29.94 
 
 
361 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  30.35 
 
 
354 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0268  histidinol-phosphate aminotransferase  24.85 
 
 
366 aa  106  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  27.27 
 
 
383 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0188  histidinol phosphate aminotransferase  23.38 
 
 
369 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.057325  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  26.32 
 
 
365 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  27.74 
 
 
365 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
361 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  26.28 
 
 
364 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  27.74 
 
 
365 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  26.28 
 
 
355 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  25.84 
 
 
364 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  26.28 
 
 
346 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  30.15 
 
 
369 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  25.53 
 
 
364 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1902  histidinol-phosphate aminotransferase  30.48 
 
 
352 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  30.35 
 
 
371 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  26.81 
 
 
357 aa  102  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  26.56 
 
 
346 aa  102  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  27.6 
 
 
367 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  30.49 
 
 
370 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  27.7 
 
 
371 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1768  histidinol-phosphate aminotransferase  30.56 
 
 
335 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1710  histidinol-phosphate aminotransferase  29.91 
 
 
335 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  30.36 
 
 
370 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  26.59 
 
 
357 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1590  histidinol-phosphate aminotransferase  25.37 
 
 
365 aa  101  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  29.01 
 
 
366 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02041  aminotransferases class-I  23.08 
 
 
369 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0980416  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2375  histidinol-phosphate aminotransferase  29.88 
 
 
356 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.323647  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  24.23 
 
 
365 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  26.93 
 
 
360 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  29.67 
 
 
349 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  25.82 
 
 
373 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  25.23 
 
 
360 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  24.84 
 
 
368 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  27.22 
 
 
353 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  28.1 
 
 
371 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>