More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2179 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2179  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
290 aa  593  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2447  ribosomal protein L11 methyltransferase  68.2 
 
 
287 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2421  ribosomal protein L11 methyltransferase  65.95 
 
 
293 aa  385  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2820  ribosomal protein L11 methyltransferase  62.14 
 
 
288 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2061  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.8 
 
 
286 aa  354  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2585  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.91 
 
 
289 aa  345  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.188755  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2021  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.48 
 
 
288 aa  342  5.999999999999999e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  40.76 
 
 
285 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  32.62 
 
 
276 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.25 
 
 
285 aa  138  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3738  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.45 
 
 
312 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3276  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.57 
 
 
279 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3507  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.03 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340912  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.36 
 
 
311 aa  127  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.6 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.14 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.7 
 
 
313 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1569  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.76 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.641228  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.78 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.91 
 
 
327 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.08 
 
 
318 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.33 
 
 
299 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.73 
 
 
307 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0528  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.22 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0113889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.81 
 
 
312 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.74 
 
 
309 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.84 
 
 
312 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.88 
 
 
304 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.66 
 
 
313 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.67 
 
 
308 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.84 
 
 
312 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.84 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.37 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.37 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.37 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.43 
 
 
302 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.37 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.21 
 
 
300 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.37 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.35 
 
 
303 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  28.38 
 
 
307 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.37 
 
 
312 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.83 
 
 
296 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.37 
 
 
312 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13478  putative ribosomal protein L11 methyltransferase  31.18 
 
 
276 aa  102  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.17 
 
 
312 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  28.57 
 
 
292 aa  102  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.25 
 
 
299 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.24 
 
 
319 aa  101  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.63 
 
 
315 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.28 
 
 
317 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.02 
 
 
287 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.02 
 
 
287 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2055  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.94 
 
 
286 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.24 
 
 
315 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.76 
 
 
316 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.84 
 
 
299 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.85 
 
 
308 aa  99  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15391  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.54 
 
 
303 aa  99  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.36 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.85 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.51 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.9 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.39 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05251  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.38 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.4 
 
 
328 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.85 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.15 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.52 
 
 
315 aa  95.9  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.15 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.81 
 
 
316 aa  96.3  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
296 aa  95.9  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.73 
 
 
299 aa  95.5  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.33 
 
 
317 aa  95.9  8e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3791  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.43 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.220237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.09 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15141  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.54 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  32.52 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.4 
 
 
297 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.96 
 
 
306 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.76 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.76 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  32.34 
 
 
264 aa  93.6  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  31.92 
 
 
321 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.85 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0609  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.58 
 
 
280 aa  93.2  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.84 
 
 
506 aa  93.2  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  31.84 
 
 
264 aa  93.2  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0096  ribosomal L11 methyltransferase  29.38 
 
 
303 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.21 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.39 
 
 
290 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.4 
 
 
300 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.21 
 
 
300 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.4 
 
 
300 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1500  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.57 
 
 
299 aa  92.4  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.51 
 
 
293 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14081  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.34 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0500355  normal  0.0701563 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.19 
 
 
302 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.7 
 
 
321 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.38 
 
 
295 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>