More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1531 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
313 aa  642    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0941  Thioredoxin-disulfide reductase  69.33 
 
 
313 aa  434  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  60.7 
 
 
313 aa  392  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03841  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.98 
 
 
317 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.04 
 
 
318 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.58 
 
 
318 aa  275  6e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.44 
 
 
318 aa  275  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1699  thioredoxin-disulfide reductase  47.02 
 
 
318 aa  273  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.54 
 
 
318 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2006  thioredoxin-disulfide reductase  45.08 
 
 
319 aa  271  9e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.827549  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.23 
 
 
318 aa  268  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.6 
 
 
318 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.97 
 
 
318 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1451  thioredoxin reductase  45.81 
 
 
322 aa  263  4e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0532473  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1583  thioredoxin-disulfide reductase  44.26 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.639711  hitchhiker  0.00905635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.45 
 
 
427 aa  199  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  35.41 
 
 
312 aa  195  8.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  39.53 
 
 
304 aa  195  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  37.67 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  37.13 
 
 
409 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  36.42 
 
 
320 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  38.34 
 
 
308 aa  186  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  37.34 
 
 
308 aa  186  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  37.91 
 
 
331 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  36.67 
 
 
304 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  35.95 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  37.91 
 
 
336 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  36.39 
 
 
318 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  36.66 
 
 
359 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  37.75 
 
 
335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  39.16 
 
 
345 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  35.64 
 
 
302 aa  182  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  37.85 
 
 
309 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  36.09 
 
 
318 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  38.03 
 
 
333 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  38.03 
 
 
333 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  38.03 
 
 
333 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  39.23 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  38.46 
 
 
312 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  38.02 
 
 
332 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  38.46 
 
 
317 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  36.94 
 
 
346 aa  178  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  35.78 
 
 
320 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  37.33 
 
 
396 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  38.78 
 
 
321 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  37.17 
 
 
309 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  35.97 
 
 
332 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  36.63 
 
 
318 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.77 
 
 
306 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  37.26 
 
 
317 aa  176  4e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  36.48 
 
 
353 aa  176  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  36.94 
 
 
326 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  36.22 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  35.78 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  36.42 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  38.96 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  38.08 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  33.99 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  33.99 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  36.18 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  35.5 
 
 
333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  35.29 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  37.62 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  35.99 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  34.31 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  36.04 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  38.08 
 
 
320 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  36.51 
 
 
324 aa  172  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  36.42 
 
 
310 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  36.66 
 
 
313 aa  171  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  37.38 
 
 
340 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  37.03 
 
 
321 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  36 
 
 
308 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  33.78 
 
 
316 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  38.22 
 
 
321 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  38.62 
 
 
304 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  36.69 
 
 
335 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  36.28 
 
 
322 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  36.28 
 
 
322 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  36.28 
 
 
322 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  36.71 
 
 
321 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  36.71 
 
 
321 aa  169  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  36.71 
 
 
321 aa  169  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  36.71 
 
 
321 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  36.71 
 
 
321 aa  169  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  36.71 
 
 
321 aa  169  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  36.71 
 
 
321 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  36.71 
 
 
321 aa  168  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  36.28 
 
 
322 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  34.43 
 
 
325 aa  169  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  36.28 
 
 
322 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  34.52 
 
 
638 aa  167  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  36.3 
 
 
325 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  36.99 
 
 
324 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  35.99 
 
 
320 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  35.81 
 
 
310 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  36.96 
 
 
340 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  36.48 
 
 
326 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  37.13 
 
 
333 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  36.77 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>