More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04853 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  98.76 
 
 
322 aa  649    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  98.76 
 
 
322 aa  649    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04853  IS1112 transposase  100 
 
 
322 aa  662    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0362678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  98.76 
 
 
322 aa  649    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  98.76 
 
 
322 aa  649    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  98.76 
 
 
322 aa  649    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  98.76 
 
 
322 aa  649    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  95.96 
 
 
322 aa  598  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  95.65 
 
 
322 aa  594  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  95.65 
 
 
322 aa  594  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  95.65 
 
 
322 aa  594  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  95.65 
 
 
322 aa  594  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  95.65 
 
 
322 aa  594  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  95.34 
 
 
322 aa  588  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  94.1 
 
 
322 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03989  IS1112 transposase  94.1 
 
 
322 aa  581  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03216  IS1112 transposase  93.48 
 
 
322 aa  578  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04791  IS1112 transposase  93.17 
 
 
322 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.030193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00803  IS1112 transposase  93.17 
 
 
322 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0987141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00579  transposase  96.5 
 
 
299 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00109  transposase  93.56 
 
 
324 aa  525  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02275  transposase  92.19 
 
 
289 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01240  transposase  93.94 
 
 
249 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.839107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04491  transposase  96.35 
 
 
219 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05593  IS1112 transposase  95 
 
 
260 aa  342  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00575  transposase  93.4 
 
 
197 aa  325  9e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00374  transposase  93.29 
 
 
164 aa  322  7e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03303  transposase  82.72 
 
 
276 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  45.57 
 
 
317 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  40.38 
 
 
313 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  40.38 
 
 
313 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  40.38 
 
 
313 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  40.38 
 
 
313 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  40.38 
 
 
313 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  40.38 
 
 
313 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  40.38 
 
 
313 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  40.06 
 
 
313 aa  236  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  41.03 
 
 
315 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  39.74 
 
 
335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01253  transposase  91.41 
 
 
159 aa  235  8e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  39.74 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  39.74 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00677  IS1112 transposase  91.41 
 
 
267 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  39.74 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  39.42 
 
 
335 aa  232  6e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  39.74 
 
 
315 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  39.74 
 
 
315 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  39.74 
 
 
315 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02914  transposase  88.59 
 
 
159 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  39.42 
 
 
315 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4284  integrase catalytic subunit  43.89 
 
 
273 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  37.98 
 
 
290 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  37.98 
 
 
290 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  37.98 
 
 
290 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03302  transposase, IS30 family  91.59 
 
 
108 aa  193  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2645  integrase catalytic subunit  42.02 
 
 
251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  36.51 
 
 
316 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  37 
 
 
380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  36.7 
 
 
380 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  36.22 
 
 
336 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  37.84 
 
 
342 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  37.5 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  37.91 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  38.32 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  37.91 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  38.27 
 
 
343 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  37.03 
 
 
457 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  38.19 
 
 
423 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  36.42 
 
 
342 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  38.19 
 
 
423 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  38.19 
 
 
423 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  38.19 
 
 
423 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  38.19 
 
 
423 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_62  putative integrase  33.01 
 
 
321 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559018  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0968  transposase  32.41 
 
 
330 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  36.71 
 
 
457 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0221  transposase  32.41 
 
 
330 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>