149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03304 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03304  SEC-C motif  100 
 
 		 92 aa  184  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556903  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  66.67 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  58.89 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5982  hypothetical protein  57.78 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  58.89 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  57.61 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  50.54 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4182  hypothetical protein  51.11 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  53.33 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  50.55 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3771  hypothetical protein  53.33 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.223155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  51.11 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  55.56 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4362  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2093  hypothetical protein  52.22 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.737091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  45.56 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0687  hypothetical protein  51.11 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.347573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4729  hypothetical protein  45.56 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0098  hypothetical protein  51.61 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0577  hypothetical protein  51.61 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3083  hypothetical protein  51.61 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.457185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2012  hypothetical protein  51.61 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0394  hypothetical protein  51.61 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0415  hypothetical protein  51.61 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2275  hypothetical protein  51.61 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  45.65 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  49.46 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0342  hypothetical protein  49.46 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899892  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1396  SecC motif-containing protein  46.74 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0319965  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  49 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0111  hypothetical protein  46.88 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  46.81 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  48.39 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  42.55 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  47.31 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  39.36 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  39.36 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  39.36 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  39.36 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  39.36 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  48.96 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  43.3 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  41.49 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  41.49 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  41.49 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  41.49 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  41.49 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  41.49 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  41.49 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  41.49 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  43.48 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  47.31 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  43.75 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  39.58 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0175  hypothetical protein  43.01 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0376  hypothetical protein  43.01 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.745389 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2944  hypothetical protein  45.16 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.878767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2841  hypothetical protein  44.09 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870685  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0458  hypothetical protein  48.39 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590063 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  40.22 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2978  hypothetical protein  44.09 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  41.94 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6272  hypothetical protein  45.16 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  45.05 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  44.57 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2315  hypothetical protein  45.16 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2929  hypothetical protein  45.16 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.620501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  40.21 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  46.24 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  41.24 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  40.86 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  40.86 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  40.4 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  40.86 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  37.89 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  41.76 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  41.3 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  36.17 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7473  hypothetical protein  42.22 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4258  hypothetical protein  41.94 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  34.78 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  33.7 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  38.46 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01838  hypothetical protein  34.78 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  41.3 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  38.95 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  39.8 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  41.76 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  42.71 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  38.54 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  46.15 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  39.58 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>