284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01365 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  100 
 
 
236 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 
243 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  47.19 
 
 
243 aa  217  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48.48 
 
 
253 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  47.37 
 
 
243 aa  216  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50.69 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.88 
 
 
249 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.48 
 
 
249 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  45.3 
 
 
247 aa  205  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.92 
 
 
269 aa  204  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.51 
 
 
262 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.64 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1338  site-specific DNA-methyltransferase  46.84 
 
 
258 aa  198  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0701  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.79 
 
 
238 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  36.97 
 
 
265 aa  148  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0913  site-specific DNA-methyltransferase  49.67 
 
 
173 aa  148  9e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3651  DNA methylase  47.51 
 
 
200 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.061929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3667  DNA methylase  48.46 
 
 
138 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.21 
 
 
223 aa  98.2  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.21 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.31 
 
 
327 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1809  DNA modification methylase-like protein  29.46 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.94 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  28.09 
 
 
227 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  28.51 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  28.52 
 
 
389 aa  88.6  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  28.4 
 
 
367 aa  88.2  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.81 
 
 
225 aa  88.6  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  27.23 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.97 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.41 
 
 
373 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.61 
 
 
239 aa  86.3  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.85 
 
 
225 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.92 
 
 
369 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.79 
 
 
382 aa  86.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  28.08 
 
 
378 aa  85.5  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  25.96 
 
 
227 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.24 
 
 
369 aa  85.1  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  25.96 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  28.02 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.2 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.4 
 
 
372 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.24 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  28.4 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  26.81 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.4 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  29.28 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  27.63 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  27.63 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.31 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.64 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.31 
 
 
380 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.77 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.2 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.31 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.24 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  30.08 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  27.63 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.31 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.34 
 
 
358 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.02 
 
 
376 aa  75.1  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  26.14 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.41 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  27.8 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.05 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  26.85 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  25.75 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  25.75 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  25.75 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  25.75 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  25.75 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  28.83 
 
 
436 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0821  haemagglutinin associated protein  26.64 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.893321  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.42 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.55 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.38 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.48 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.69 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.55 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  25.66 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.02 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  27.71 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.9 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.902503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.67 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  26.97 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.67 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.67 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  26.67 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  26.67 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  26.67 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.45 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.59 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.56 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.2 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  26.59 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.97 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  26.59 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.59 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.59 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.22 
 
 
283 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>