More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00718 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
322 aa  663    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.57 
 
 
336 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.46 
 
 
331 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.46 
 
 
331 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.42 
 
 
335 aa  361  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1330  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.84 
 
 
330 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000518918  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.55 
 
 
331 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.47 
 
 
316 aa  359  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.25 
 
 
331 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.25 
 
 
331 aa  358  5e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.25 
 
 
331 aa  358  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.25 
 
 
331 aa  358  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.25 
 
 
331 aa  358  5e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.51 
 
 
331 aa  358  8e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.23 
 
 
331 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.69 
 
 
298 aa  357  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.14 
 
 
331 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  55 
 
 
331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.92 
 
 
331 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.23 
 
 
344 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.41 
 
 
301 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  56.88 
 
 
315 aa  353  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.38 
 
 
320 aa  353  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.92 
 
 
331 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.27 
 
 
331 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.75 
 
 
306 aa  352  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.14 
 
 
331 aa  352  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0886  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.28 
 
 
324 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00104567  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.69 
 
 
301 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.73 
 
 
334 aa  348  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.56 
 
 
332 aa  348  6e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.31 
 
 
301 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.11 
 
 
332 aa  348  9e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.29 
 
 
331 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.29 
 
 
331 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0371  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.1 
 
 
320 aa  345  6e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.789292 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.56 
 
 
332 aa  345  7e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0396  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.1 
 
 
334 aa  345  8e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0701644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.01 
 
 
336 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.52 
 
 
336 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.41 
 
 
317 aa  342  4e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.21 
 
 
331 aa  342  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0436  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.25 
 
 
353 aa  342  7e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.76 
 
 
310 aa  341  8e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.89 
 
 
315 aa  341  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.9 
 
 
331 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.23 
 
 
344 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.23 
 
 
344 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.23 
 
 
344 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.23 
 
 
344 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.91 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2855  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.29 
 
 
315 aa  339  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.6 
 
 
344 aa  339  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.99 
 
 
337 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.6 
 
 
344 aa  338  9e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.99 
 
 
341 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.29 
 
 
337 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.58 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3992  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.29 
 
 
333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.29 
 
 
337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.92 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.96 
 
 
336 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.44 
 
 
332 aa  335  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.37 
 
 
331 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.29 
 
 
332 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.83 
 
 
344 aa  334  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3633  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.82 
 
 
338 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.87 
 
 
311 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.46 
 
 
318 aa  332  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0133  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.11 
 
 
300 aa  332  5e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158116  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.78 
 
 
331 aa  332  6e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5586  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.62 
 
 
326 aa  332  6e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18066  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.09 
 
 
319 aa  332  6e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.77 
 
 
315 aa  331  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.59 
 
 
319 aa  330  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.59 
 
 
319 aa  330  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.81 
 
 
302 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0623  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.05 
 
 
305 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.23 
 
 
338 aa  329  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.46 
 
 
315 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.19 
 
 
366 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.18 
 
 
337 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.08 
 
 
337 aa  328  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.19 
 
 
366 aa  328  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.58 
 
 
337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.89 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.24 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2049  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.11 
 
 
315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00190211  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.31 
 
 
313 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1893  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.9 
 
 
334 aa  325  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.772909  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  51.19 
 
 
337 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.38 
 
 
337 aa  324  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.45 
 
 
313 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.05 
 
 
333 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.98 
 
 
333 aa  323  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.73 
 
 
313 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.37 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.37 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.12 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.37 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>