39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00232 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  43.93 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  31.38 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  30.05 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  31.69 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  32.04 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  29.1 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  35.63 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  28.57 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5237  transcriptional regulator NfxB  31.84 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  28.96 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60810  putative transcriptional regulator NfxB  30.77 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  27.53 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  28.98 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
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NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 189 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 189 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 185 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 232 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
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NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
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NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
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NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  32.35 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 180 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
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