More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5310 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  94.32 
 
 		 458 aa  909    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  83.62 
 
 		 460 aa  813    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  86.93 
 
 		 459 aa  848    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  100 
 
 		 458 aa  949    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  83.62 
 
 		 460 aa  813    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  99.34 
 
 		 458 aa  947    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  91.7 
 
 		 458 aa  876    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  96.29 
 
 		 458 aa  920    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  93.01 
 
 		 458 aa  899    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  94.1 
 
 		 458 aa  909    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  87.77 
 
 		 458 aa  850    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  87.77 
 
 		 458 aa  843    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  93.45 
 
 		 458 aa  900    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  84.06 
 
 		 460 aa  817    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  83.62 
 
 		 460 aa  813    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  87.55 
 
 		 458 aa  843    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  87.55 
 
 		 458 aa  845    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  87.55 
 
 		 458 aa  842    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  50.67 
 
 		 456 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  44.97 
 
 		 461 aa  415  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  45.62 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  43.6 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  44.42 
 
 		 455 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  43.82 
 
 		 472 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  43.82 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  43.82 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  43.82 
 
 		 472 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  43.82 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  47.47 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  43.82 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  43.82 
 
 		 472 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  43.82 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  43.33 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  43.6 
 
 		 472 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  43.08 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  41.43 
 
 		 463 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  42.51 
 
 		 455 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  42.3 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  43.3 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  44.19 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  42.86 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  42.32 
 
 		 459 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  42.32 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  42.32 
 
 		 454 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  41.27 
 
 		 464 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  42.09 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  42.63 
 
 		 454 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  43.18 
 
 		 454 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  42.06 
 
 		 455 aa  360  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  42.95 
 
 		 454 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  40.61 
 
 		 468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  40.61 
 
 		 464 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  41.74 
 
 		 471 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  39.39 
 
 		 459 aa  335  9e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  39.44 
 
 		 453 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  37.89 
 
 		 455 aa  332  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  38.53 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  37.02 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  41.11 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  37.61 
 
 		 445 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  36.69 
 
 		 448 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2634  glutamate--putrescine ligase  37.25 
 
 		 448 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  37.38 
 
 		 439 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  37.16 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  37.16 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2178  glutamine synthetase, putative  36.47 
 
 		 448 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  36.81 
 
 		 451 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  36.47 
 
 		 448 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  38.48 
 
 		 450 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1845  glutamine synthetase catalytic region  35.12 
 
 		 451 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561959  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  36.61 
 
 		 479 aa  282  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  39.17 
 
 		 458 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3721  glutamine synthetase catalytic region  35.35 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.504584  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4806  glutamine synthetase catalytic region  34.74 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  33.62 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4278  glutamine synthetase, catalytic region  34.74 
 
 		 448 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  0.233785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1253  glutamine synthetase, catalytic region  34.37 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0804  glutamine synthetase, catalytic region  34.23 
 
 		 448 aa  272  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0418139  normal  0.144728 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3465  glutamine synthetase, catalytic region  34.45 
 
 		 448 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5385  glutamine synthetase catalytic region  34.45 
 
 		 448 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4901  glutamine synthetase, catalytic region  34.45 
 
 		 448 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  33.19 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  32.97 
 
 		 452 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  33.19 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  34.51 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  34.51 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  34.29 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  36.07 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  34.29 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  33.63 
 
 		 453 aa  270  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  34.29 
 
 		 452 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  34.29 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  36.04 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  34.07 
 
 		 452 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  33.85 
 
 		 452 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  34.29 
 
 		 452 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  34.5 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1093  glutamate--ammonia ligase  33.85 
 
 		 451 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2828  L-glutamine synthetase  32.74 
 
 		 468 aa  263  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  34.54 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>